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    連鎖不平衡(LD)分析币厕。

    在群體遺傳學(xué)研究中必搞,LD連鎖不平衡分析是非常常見的內(nèi)容皱卓,同時也是關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)。在很多的遺傳進化GWAS的文章中都會出現(xiàn)LD衰減或者block單倍型塊的圖。那么什么是連鎖不平...

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  • R 基礎(chǔ)繪圖同時保存pdf和png

    之前遇到過要同時保存pdf和png的情況,因為是用ggplot2繪圖,所以就直接用ggsave兩次就可以了泵督,但是如果是用低級繪圖plot的話,就要換種辦法了庶喜。下面介紹兩種

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    使用pheatmap包繪制熱圖

    加載所需R包 設(shè)置工作路徑 構(gòu)建測試數(shù)據(jù)集 將熱圖結(jié)果按聚類后的順序輸出

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    R 繪制花瓣圖flower plot

    花瓣圖 對于多樣本的研究小腊,我們可以采用繪制花瓣圖來更直觀展現(xiàn),每個樣本所獨有的otu數(shù)目和共有的otu數(shù)目久窟。 花瓣圖繪制的原理 因為沒有一個相關(guān)的R包秩冈,參照的是博客(http...

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