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安裝R-package XML遇到的問(wèn)題和解決方式
科學(xué)網(wǎng)—安裝R-package XML遇到的問(wèn)題和解決方式 - 郭可欣的博文 (sciencenet.cn)[https://blog.scie...
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整理單細(xì)胞多樣本整合相關(guān)的文章
1. jimmy老師： https://cloud.tencent.com/developer/article/1692238[https://...
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預(yù)測(cè)模型基礎(chǔ)知識(shí)統(tǒng)計(jì)研究層次 初級(jí)統(tǒng)計(jì)（描述性統(tǒng)計(jì)）：x±s， 中級(jí)統(tǒng)計(jì)（差異性分析）：t檢驗(yàn)2對(duì)象，F(xiàn)檢驗(yàn)3對(duì)象脂崔，卡方檢驗(yàn)，非參數(shù)檢驗(yàn) 高級(jí)統(tǒng)計(jì)（關(guān)系性分析）...
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創(chuàng)建目錄和空白文件
概述 mkdir 命令可以創(chuàng)建新目錄戏阅。mkdir 是 make directory 的縮寫橙凳。 語(yǔ)法 mkdir 命令的基本語(yǔ)法如下：mkdir ...
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RNA-Seq基本概念
RNA-seq數(shù)據(jù)和microassay在差異表達(dá)分析上的區(qū)別: RNA-Seq觀察到的數(shù)據(jù)是抽樣過(guò)程中產(chǎn)生的離散（discrete) coun...
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Part2：scRNA-seq--standard Seurat clustering pipeline來(lái)源 0. 降維 scRNA分析就是在于數(shù)據(jù)打交道。本來(lái)看不見(jiàn)摸不著的基因彭羹，現(xiàn)在體現(xiàn)在數(shù)據(jù)上黄伊，雖然還是摸不著，但能看得到派殷。每個(gè)基因現(xiàn)在都作為數(shù)據(jù)...
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RPKM/FPKM/TPM標(biāo)準(zhǔn)化方法區(qū)別
幾種豐度計(jì)算方法 feature 定義: 基因組上對(duì)具有不同性質(zhì)區(qū)域的定義(例如: gene/exon/intron/miRNA等)还最。優(yōu)點(diǎn): 利...
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Part1：scRNA-seq質(zhì)控+標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)控來(lái)源： 質(zhì)控步驟 1. 下載GSE152048基因表達(dá)矩陣（BC3） 導(dǎo)入后結(jié)果： 2. 安裝seurat包 3. 讀取數(shù)據(jù) Seurat...