個人使用記錄留存鹉动，與分享jupyter Lab和Notebook是一家焦辅，前者是后者的升級版寝姿，也能切換成后者 jupyter安裝 通過conda安裝，單獨開一個環(huán)境扒吁，保持bas...
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jupyter的服務(wù)器安裝與多conda環(huán)境使用 -
非Visium空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)Seurat分析流程本打工人跑過很多不同測序技術(shù)的空轉(zhuǎn)數(shù)據(jù)凹蜈，不同的測序技術(shù)平臺提供的分析方式也各有千秋振峻，不過本人習(xí)慣了使用seurat公般，以下是總結(jié)的可以把其他空轉(zhuǎn)數(shù)據(jù)導(dǎo)入到seurat空轉(zhuǎn)流程中...
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可直接用的Seurat單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組整合（去批次）流程万搔，最新版整理
以前跑過很多次的單細(xì)胞整合分析，很多時候都因為沒有很好的總結(jié)就得重新寫浪費時間現(xiàn)如今整理了一個到手就能直接用的腳本官帘，根據(jù)Seurat官方最新流程總結(jié) 可直接調(diào)用的代碼瞬雹，需要修...
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seurat-PrepSCTFindMarkers源碼解析一、FindAllMarkers()函數(shù)報錯 最近事情太多刽虹，好久沒有寫簡書酗捌，斷更很久，慚愧涌哲。前幾天胖缤，將服務(wù)器的seurat包升級到4.1.0版本，在跑單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組流程的時候發(fā)...
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02Single-cell lineage tracing unveils a role for TCF15 in haematopoiesis單細(xì)胞譜系追蹤揭示了TCF15在造血中的作用 發(fā)表期刊：Nature 發(fā)表日期：2020年7月 發(fā)表單位：哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院 文本目錄: 1. 一些之前不知道的基礎(chǔ)知識2. Ab...
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二代測序序列拼接：flash
轉(zhuǎn)自：https://mp.weixin.qq.com/s/lgJDpwk0vYipARfTorfCkA[https://mp.weixin.qq.com/s/lgJDpwk...
