R包安裝遇到的問題： 在安裝R包時绒净，通常會采用：install.packages("xxx") 進行安裝妹田，有時會碰到如下錯誤信息： package 'xx...
發(fā)簡信
IP屬地：黑龍江
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ggplot2圖例調(diào)成一列排龄，終于找到了解決辦法
有時圖例較多蜒灰，用ggplot2畫圖時候會出現(xiàn)圖例占據(jù)圖的半壁江山吏垮，想讓圖例排成一列祈搜，解決方法如下： guides(fill = guide_legend( ncol = 1,...
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宏基因組--微生物多樣性操作分類單元（Operational Taxonomic Units缕减，OTU）是在系統(tǒng)發(fā)生學(xué)研究或群體遺傳學(xué)研究中，為便于分析捞奕，人為給某一個分類單元（品系娄昆，種，屬缝彬，分組等）設(shè)...
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不同組的實驗數(shù)據(jù)如何進行差異性分析以下內(nèi)容參考出處（侵刪）：https://zhuanlan.zhihu.com/p/57756620 差異研究的目的在于比較兩組數(shù)據(jù)或多組數(shù)據(jù)之間的差異，通常包括以下幾類分析...
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通過blast在基因組中找相似序列人類基因組中存在大量的重復(fù)區(qū)域夺姑，給定一段序列墩邀，如何知道這段序列在基因組中是否具有唯一比對，或者具有多個比對盏浙？ 一種方法是通過bwa眉睹，通過AS和XS 標(biāo)簽判斷是否有次優(yōu)比對；但...
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測序有關(guān)問題
1.為什么要在上機測序之前做PCR擴增斋配？ 測到的reads數(shù)取決于flowcell上長了多少cluster（1個模板鏈擴增出一簇分子），有多少cluster，理論上就得到多少...
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perl模塊非root權(quán)限安裝
第一步：編輯bashrc 編輯 ~/.bashrc 文件艰争，第一個變量$LOCAL_APP根據(jù)自己情況修改坏瞄，后面直接復(fù)制。 #local app path LOCAL_APP=...
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如何理解PCR跑膠圖
圖分為兩部分： 1.左邊 最左邊亮度階梯分布甩卓，不同高度代表PCR片段長度的不同鸠匀，片段越短，跑的越快猛频，為最下方的條帶狮崩。片段越長，跑的越慢鹿寻，為最上方的條帶睦柴。最左邊為一個參考條帶；...
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sort常用命令---持續(xù)更新
1.對不同的列進行不同的排序方式 sort -k1,1 -k2,2n -k1,1 表示對第一列進行字符串比較 1,1表示起始列為第一列毡熏，終止列也為第一列 -k2,2n 表示僅...
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rsync常用命令--持續(xù)更新
1. 實現(xiàn)目錄下大批量文件的刪除 當(dāng)某個目錄下存在大批量文件的時候坦敌，如果用rm 命令進行刪除，會很慢痢法； 解決方法： 先創(chuàng)建一個空目錄 mkdir Blank 然后 rsync...
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find常用功能----持續(xù)更新
1. 按照時間查詢文件 先touch 兩個時間標(biāo)記文件 touch -t 07120800 start #####07120800 代表的意思（月狱窘，日，時财搁，分） tou...
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awk常用功能--持續(xù)更新
1. awk命令實現(xiàn)文本內(nèi)容行列轉(zhuǎn)化 awk -F '\t' '{for(i=1;i<=NF;i=i+1){a[NR,i]=$i}}END{for(j=1;j<=NF;j++...
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SRA-toolkit使用
之前下載SRA的數(shù)據(jù)蘸炸，使用 prefetch -v SRA --max-size 100G 下載數(shù)據(jù)，經(jīng)常會出現(xiàn)下到一半就斷網(wǎng)的情況尖奔；后來嘗試使用wget下載搭儒，但...
