發(fā)簡信
IP屬地：浙江
-
Two-Way ANOVA前言 Two-Way ANOVA由于有兩個自變量狼讨，在考慮兩個變量單獨對應變量影響的同時逗抑，還需要考慮交互作用 當ANOVA結(jié)果顯示交互作用差異顯著...
-
Pheatmap轉(zhuǎn)ggplot2
問題 pheatmap出的熱圖添加腳注恩掷、拼圖等都非常麻煩 老的解決方案 由于pheatmap是基于grid畫圖的楷力，因此可以用grid的語句添加注...
-
使用DESeq2標準化之后的數(shù)據(jù)進行PCA趟妥、聚類等可視化
DESeq2進行數(shù)據(jù)標準化的命令有多種 counts(dds, normalized=T) rlog棍弄、VST 兩者的區(qū)別在于 前者 are “o...
-
【R】批量T檢驗
注意事項 本代碼適用于Student T檢驗檬嘀，別的統(tǒng)計方法需要改代碼 本代碼中默認數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布且方差齊，如果數(shù)據(jù)對這兩項敏感握侧，則需要提前檢驗...
-
【R】不使用EXPORT包蚯瞧，導出圖片到PPT
最近EXPORT包從CRAN下架了。雖然還是可以下載到舊版本進行本地安裝藕咏。但是在實際出圖的時候很可能報錯： 原因是EXPORT的依賴包RVG在更...
-
標準化状知、歸一化和數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換
高通量數(shù)據(jù)分析過程中常見的三個概念，非常容易混淆孽查。 標準化 Data Scaling 為了使不同變量之間可以比較，例如 轉(zhuǎn)錄組中有些基因本身表達...
-
【R】批量完成Oneway ANOVA坦喘，并以Mean±SD格式（帶差異標記）導出到EXCEL批量完成Oneway ANOVA之前其實就寫過盲再，但是老的代碼對剛?cè)腴TR語言的人可能還是不太友好，因此又修改了一版瓣铣。這一版的代碼可以說即使不懂R語...
-
用ggplot2畫Pathway氣泡圖
成品圖 橫坐標為pathway impact 縱坐標為pathway名稱答朋。這里是我瞎編的 氣泡的顏色代表p值 氣泡的大小代表富集到的代謝物數(shù)量。...
-
用ggplot2畫代謝集富集分析（MSEA）圖MSEA 什么是MSEA MSEA棠笑，Metabolite Set Enrichment Analysis梦碗，代謝集富集分析，是代謝組數(shù)據(jù)分析方法的...