參考教程：https://www.biostars.org/p/285296/[https://www.biostars.org/p/285296/]image整體思路可分為...
發(fā)簡(jiǎn)信
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igraph包可視化基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò) -
非模式生物KEGG富集分析寫在前面 因?yàn)槲已芯康奈锓N比較小眾，很多注釋不完全衩茸，R包AnnotationHub中也沒有對(duì)應(yīng)信息芹血，所以無法使用公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行kegg富集分析。所以自己嘗試使用KAAS造一個(gè)...
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R數(shù)據(jù)分析：混合效應(yīng)模型的可視化解釋，再不懂就真沒辦法
好多同學(xué)咨詢我混合效應(yīng)模型幔烛，有些問題自己需要講很多遍啃擦，想想就再開一貼，爭(zhēng)取這一篇文章給大家寫清楚饿悬。 混合效應(yīng)模型名字很多令蛉，Hierarchical Modeling, als...
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哦，走開狡恬，你這個(gè)可惡的離群值1.離群值是啥子[http://222.70.95.243:6893/files/tmp/%E7%A6%BB%E7%BE%A4%E5%80%BC%EF%BC%8C%E6%88...
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RNA-seq 數(shù)據(jù)分析最佳實(shí)戰(zhàn)（綜述）一篇RNA-seq分析流程的綜述珠叔，全面而詳細(xì)！深度好文弟劲，可用來反復(fù)閱讀祷安。初學(xué)者用于把握RNA-seq真?zhèn)€流程及各個(gè)流程選擇上的差異。已經(jīng)開始學(xué)習(xí)者可用來查缺補(bǔ)漏和發(fā)現(xiàn)新的分析...
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R語言直接將圖片導(dǎo)出至pptx或docx
在之前學(xué)習(xí)的時(shí)候兔乞，老師有推薦"export"這個(gè)神器可以將圖片直接導(dǎo)出至ppt汇鞭，但是發(fā)現(xiàn)3.6及4.0版本的R語言仍然無法使用export。因此庸追，切換至另外一個(gè)叫"eoffi...
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判斷GEO芯片數(shù)據(jù)表達(dá)矩陣是否需要log2轉(zhuǎn)換通過exprs函數(shù)獲取表達(dá)矩陣后我們可以通過以下三種方法判斷是否需要進(jìn)行l(wèi)og2轉(zhuǎn)換 1.肉眼識(shí)別 最簡(jiǎn)單粗暴的方法就是霍骄，根據(jù)數(shù)值大小粗略估計(jì)：如果表達(dá)量的數(shù)值在50以內(nèi)，通...
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轉(zhuǎn)錄組分析——利用GEO數(shù)據(jù)挖掘構(gòu)建基因表達(dá)圖譜一淡溯、前言 前段時(shí)間主管讓我在GEO數(shù)據(jù)庫弄個(gè)表達(dá)圖譜读整，準(zhǔn)備接下來做各種轉(zhuǎn)錄組分析，現(xiàn)在回過頭來血筑，覺得這個(gè)東西比較簡(jiǎn)單绘沉，十分適合上手練習(xí)。思考了一下豺总，決定寫下來分享給大家车伞。注意...
