筆記內(nèi)容：由二代測(cè)序產(chǎn)生的序列數(shù)據(jù)（.fastq）到OTU table吟温， 距離矩陣蔫浆，物種多樣性指數(shù)竟终，序列的進(jìn)化樹(shù)及物種注釋信息的可分析數(shù)據(jù)并蝗，為常規(guī)分析流程〗胀祝可以使用usear...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：四川
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微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小結(jié)：從OTU table到marker物種 -
基于R語(yǔ)言的微生物群落組成多樣性分析——CCA分析????之前文章中我們講到過(guò)冗余分析（redundancy analysis, RDA）滚停，今天我們來(lái)講另一種分析——典范對(duì)應(yīng)分析（canonical corresponden...
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當(dāng)你用setwd的時(shí)候河劝，能考慮一下Rproject的感受嗎
我在線下課程中講過(guò)凭迹，R語(yǔ)言文件讀取只有一個(gè)報(bào)錯(cuò)多艇，就是： 傳統(tǒng)的R語(yǔ)言書(shū)和課程里會(huì)講强衡，setwd（）這個(gè)命令是設(shè)置工作目錄用的拨齐，所謂工作目錄就是圖片導(dǎo)出交播、腳本保存盅粪、數(shù)據(jù)讀取的默...
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ANI AAI TETRA Mash比較基因組導(dǎo)讀 比較平均核酸一致性average nucleotide identity（ANI）和氨基酸一致性amino acid identity（AAI）是比較基因組常用的兩種基...
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5-【ANI堪夭、AAI咏删、dDDH】的安裝和使用（2021.2.4）
安裝時(shí)間：2021.2.4 1. 簡(jiǎn)介 目前原核生物常用的分的界定標(biāo)準(zhǔn)有三種惹想，包括基因組之間的平均氨基酸均一性（Average Nucleotide Identity, AN...
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有道云筆記網(wǎng)頁(yè)剪報(bào) Chrome插件-登錄問(wèn)題問(wèn)題描述：Chrome 網(wǎng)頁(yè)剪報(bào)收藏筆記每次都需要登錄且剪報(bào)收藏失敗報(bào)錯(cuò)登錄后，再點(diǎn)擊收藏時(shí)報(bào)如下錯(cuò)誤：{canTryAgain: false,scope: "SECURIT...
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使用Windows做生信 | WSL生信分析環(huán)境搭建
以前聯(lián)系linux都是安裝虛擬機(jī)督函，不過(guò)現(xiàn)在微軟發(fā)布了Windows子系統(tǒng)（WSL）嘀粱，使我們可以非常方便地獲得linux環(huán)境，進(jìn)行聯(lián)系甚至用于實(shí)際的工作和生產(chǎn)中辰狡。下面锋叨，就讓我們...
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更新R version 4.0.0 后安裝配置Rtools（第一次發(fā)帖，任何問(wèn)題請(qǐng)見(jiàn)諒宛篇，后續(xù)會(huì)不斷改進(jìn)） 1. R 4.0.0的更新 采用《R語(yǔ)言實(shí)戰(zhàn)》第2版附錄中的方法更新娃磺，即安裝“installr”包進(jìn)行更新。 會(huì)自動(dòng)彈出鏡像選...
