以下是B站生信技能樹GEO數(shù)據(jù)庫挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的： 介紹GEO數(shù)據(jù)庫：了解數(shù)據(jù)存放位置蛔翅； 介紹GSE項(xiàng)目的3種下載方式漆枚； 介紹ID轉(zhuǎn)換：使用R語言技巧實(shí)現(xiàn)基...
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GEO數(shù)據(jù)庫挖掘—生信技能樹B站視頻 -
RNA速度-RNA velocity是什么
一句話評價(jià)通過動(dòng)態(tài)模型評估細(xì)胞瞬間狀態(tài)的RNA速度 文章信息題目：Generalizing RNA velocity to transient cell states thr...
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R語言作圖——Line plot
原創(chuàng):黃小仙 最近小仙同學(xué)在Nature Cell Biology上看到了這樣一張圖屠列，很常見的折線圖畫成這個(gè)樣子——原來很常見的圖標(biāo)類型也可以“煥發(fā)新春”聚谁！ 今天小仙同學(xué)就嘗...
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[ 生信者們建議看看 1 ] Ming Tang: 我為生物信息學(xué)/數(shù)據(jù)科學(xué)課程選擇的書籍/ URL放在最前面的鏈接：My opinionated selection of books/urls for bioinformatics/data science curricu...
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GEO數(shù)據(jù)分析之GSEAGSEA-analysis 1.加載數(shù)據(jù) 載入前一步分析得到的表達(dá)矩陣 2.批量相關(guān)性分析 將第一行目的基因跟其他行的編碼基因批量做相關(guān)性分析蹂随，得到相關(guān)性系數(shù)以及p值锹漱。 3....
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Hi-C文獻(xiàn)解讀15年3月發(fā)表的一篇高引文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4542312/ Cited by: 371 Publi...
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繼續(xù)學(xué)習(xí)TCGA-使用R包TCGA-biolinks下載數(shù)據(jù)參考學(xué)習(xí)資料：還是小潔老師的TCGA-3.R包TCGA-biolinks下載數(shù)據(jù)下載安裝包 這個(gè)包有點(diǎn)大佩谷，安裝需要點(diǎn)時(shí)間其實(shí)從知道這個(gè)包名，應(yīng)該就知道怎么學(xué)習(xí)了婿牍，不用贅述 學(xué)...
