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富集分析圈圈圖0.需求解讀 這是富集分析比較常見的一個圖，左圖右表。 圖的最外層是GOterm的編號，中間灰色背景層表示基因的logFC分布，可以看到每個te...
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如何用Conda安裝GATK阀蒂？劉小澤寫于2020.9.2現(xiàn)在conda的使用越來越方便，用的人也越來越多，就是因為學(xué)習(xí)成本簡單赫舒，比較容易上手，并且不需要root權(quán)限以及修改b...
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bedtools的簡單操作版本
劉小澤寫于2020.8.14 前言 之前初識bedtools的時候根據(jù)官網(wǎng)教程寫了一個接近于實戰(zhàn)的教程：2019 和豆豆一起跟著官網(wǎng)學(xué)習(xí) bed...
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生信星球小練習(xí)—批量讀取10X數(shù)據(jù)劉小澤寫于2020.8.13主要分為兩個部分：前面用linux處理闽瓢，后面用R處理 下載數(shù)據(jù) 選用的10X測試數(shù)據(jù)是：https://www.nc...
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會了GEO數(shù)據(jù)下載接癌，來看看怎么上傳吧劉小澤寫于2020.8.12 1 注冊NCBI GEO賬號 先注冊NCBI賬號，在：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ...
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跟著官方文檔來看看GRanges這個對象劉小澤寫于2020.8.5今天跟著官方文檔來看看GRanges這個對象 1 前言 內(nèi)容來自：https://bioconductor.org/p...
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單細胞交響樂31-實戰(zhàn)十四 10X HCA計劃的38萬骨髓細胞劉小澤寫于2020.7.22為何取名叫“交響樂”扣讼？因為單細胞分析就像一個大樂團缺猛，需要各個流程的協(xié)同配合單細胞交響樂1-常用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)Single...
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單細胞交響樂30-實戰(zhàn)十三 10X 小鼠乳腺上皮細胞
劉小澤寫于2020.7.21為何取名叫“交響樂”？因為單細胞分析就像一個大樂團椭符，需要各個流程的協(xié)同配合單細胞交響樂1-常用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)Single...
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單細胞交響樂29-實戰(zhàn)十二 10X 小鼠嵌合體胚胎劉小澤寫于2020.7.21為何取名叫“交響樂”荔燎？因為單細胞分析就像一個大樂團，需要各個流程的協(xié)同配合單細胞交響樂1-常用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)Single...