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【R與R Studio】2021.10.111离赫、R語(yǔ)言是一門用函數(shù)處理數(shù)據(jù)的編程語(yǔ)言墓阀。 2、RStudio是R語(yǔ)言的集成開(kāi)發(fā)環(huán)境瓤狐,打開(kāi)后頁(yè)面可見(jiàn)...
目標(biāo)二:數(shù)據(jù)預(yù)處理础锐,探針I(yè)D轉(zhuǎn)換嗓节,探針去重1、數(shù)據(jù)預(yù)處理自動(dòng)log2化皆警,解釋 以上代碼在GEO官網(wǎng)可查拦宣。 2、探針基因名轉(zhuǎn)換platformMa...
目標(biāo)一:下載GEO數(shù)據(jù),以GSE42872為例方法一:通過(guò)加裝GEOquery包鸵隧,使用getGEO函數(shù)可以得到對(duì)應(yīng)GEO好的表達(dá)矩陣绸罗,注釋信息,...
2021.9.22中秋節(jié)后新的練習(xí)開(kāi)始啦~練習(xí)用的是“nycflights13”的數(shù)據(jù)豆瘫。 目標(biāo):學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)選取的三種思維模式 【一】通過(guò)位置獲取 ...
2021.9.16題目:已有信息ensembl_id珊蟀,找到對(duì)應(yīng)的基因名(symbol)思路:通過(guò)ensembl_id確定gene_id,再通過(guò)g...