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  • 為什么call peak的時(shí)候RYBP用的q值是0.01而其他樣本都用的0.05,這是RYBP沒有peak的原因嗎?

    ChIP-seq基礎(chǔ)入門

    理解ChIP-Seq 到了目前這個(gè)水平,我學(xué)習(xí)新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時(shí)已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫的問題了。我更多要去考慮一個(gè)技術(shù)的目的和意義矗蕊。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問題是基因在不...

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    ChIP-seq基礎(chǔ)入門

    理解ChIP-Seq 到了目前這個(gè)水平,我學(xué)習(xí)新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時(shí)已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫的問題了。我更多要去考慮一個(gè)技術(shù)的目的和意義蜗元。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問題是基因在不...

  • RNA-seq芯杀,Ribo-seq數(shù)據(jù)分析(上)

    文獻(xiàn):The Tomato Translational Landscape Revealed by Transcriptome Assembly and Ribosome P...

  • 全基因組關(guān)聯(lián)分析流程

    按照前人的教程筛圆,跑了跑GWAS流程核偿,作為初學(xué)者,歡迎大家提問顽染,指教漾岳。 數(shù)據(jù)來源:A new regulator of seed size control in Arabido...

  • 請教一下師兄,提取172個(gè)樣本之后有些位點(diǎn)出現(xiàn)的MAF=0粉寞,是不是就是說尼荆,在大群體中該位點(diǎn)有變異而對于這個(gè)172樣本的群體而言這個(gè)位點(diǎn)沒有變異?

    重復(fù)一篇文獻(xiàn)的GWAS(一):基因型數(shù)據(jù)整理

    文獻(xiàn):A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a genome-wide asso...

  • RNA-seq中基因表達(dá)表達(dá)定量單位選擇

    做RNA-seq可以比較不同樣本之間基因表達(dá)水平的差異唧垦,那么如何衡量基因的表達(dá)水平呢捅儒? 最簡單的方法是,直接比較mapping到某一個(gè)基因的reads數(shù)目振亮。但是這種做法有不足...

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