1. 簡(jiǎn)介 subprocess 是 Python 的一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)庫(kù)佃牛，它允許你啟動(dòng)新的進(jìn)程白筹、連接到它們的輸入/輸出/錯(cuò)誤管道窟感，并且獲取它們的返回值稠歉。該庫(kù)使 Python 程序能夠...
IP屬地：浙江
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subprocess：python中執(zhí)行外部命令 -
Docker鏡像換源（加速下載）
1、確認(rèn)docker是否安裝 或 2、確認(rèn)docker服務(wù)名稱(chēng)（后面會(huì)用到） 確認(rèn) Docker 服務(wù)的正確名稱(chēng)。在基于 systemd 的系統(tǒng)中皇忿，可以使用以下命令查找所有 ...
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hydra--參數(shù)管理包
一、hydra的詳細(xì)用法舉例 Hydra 是一個(gè)用于構(gòu)建復(fù)雜應(yīng)用程序的配置框架坦仍，它允許你通過(guò)命令行參數(shù)鳍烁、環(huán)境變量或配置文件來(lái)覆蓋配置值。以下是 Hydra 在 Python ...
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pt是訓(xùn)練好的模型參數(shù)繁扎，同一個(gè)模型肯定是一樣的幔荒。embedding的維度是一個(gè)固定的值比如1024，就是把不同氨基酸長(zhǎng)度的蛋白最終都轉(zhuǎn)換成了一個(gè)由1024個(gè)數(shù)字組成的向量梳玫。
用esm模型do蛋白 embedding
Github官方文檔包含了整個(gè)包的所有代碼及使用方法：Github官方文檔：https://github.com/facebookresearch/esm[https://g...
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是的铺峭，當(dāng)確定超參數(shù)13后，需要重新訓(xùn)練一遍模型作為最終使用的模型汽纠，這個(gè)時(shí)候可以不用驗(yàn)證和測(cè)試集了（至少驗(yàn)證集可以不用了），把驗(yàn)證集（和測(cè)試集）都作為訓(xùn)練集傀履，這樣能保證最終的模型有更多的樣本進(jìn)行訓(xùn)練虱朵，使模型泛化性能更好。我這里只是拿KNN做了示范钓账，隨機(jī)森林等其他方法是一樣的碴犬。
單一驗(yàn)證、k折交叉驗(yàn)證（特例：留一法（LOOCV））梆暮、交叉驗(yàn)證確定最優(yōu)超參數(shù)
一服协、單一驗(yàn)證 1、單一訓(xùn)練集和測(cè)試集 最簡(jiǎn)單的樣本集劃分就是只有訓(xùn)練集和測(cè)試集啦粹，而沒(méi)有驗(yàn)證集偿荷，因此無(wú)法利用驗(yàn)證集反過(guò)來(lái)對(duì)模型參數(shù)進(jìn)行調(diào)整。只能先給定一組超參數(shù)C唠椭，然后訓(xùn)練得到...
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★GPU跳纳、GPU驅(qū)動(dòng)、CUDA贪嫂、CUDA Toolkit寺庄、cuDNN的關(guān)系
https://haokan.baidu.com/v?pd=wisenatural&vid=9064106905869811204[https://haokan.baidu....
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nbextensions插件（重要）
該插件在linux下設(shè)置好后，在本地遠(yuǎn)程打開(kāi)linux上的jupyter notebook后依然有效。 ★jupyter notebook版本過(guò)高（7及更高）會(huì)導(dǎo)致不支持nb...
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連續(xù)子圖抽榷诽痢：根據(jù)指定目標(biāo)節(jié)點(diǎn)抽取連續(xù)子圖k_hop_subgraph()當(dāng)需要從一個(gè)圖中抽取某一個(gè)或一系列節(jié)點(diǎn)（目標(biāo)節(jié)點(diǎn)）周?chē)膋級(jí)連續(xù)節(jié)點(diǎn)時(shí)赢织，可以用PyG的 k_hop_subgraph() 方法。k=1：與目標(biāo)節(jié)點(diǎn)直接相連的節(jié)點(diǎn)馍盟；k=2：與目...
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PyG構(gòu)建圖對(duì)象并轉(zhuǎn)換成networkx圖對(duì)象一于置、寫(xiě)在前面 PyG 是一款基于PyTorch 的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)庫(kù)，它提供了很多經(jīng)典的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型和圖數(shù)據(jù)集朽合。在使用 PyG 框架來(lái)構(gòu)建和訓(xùn)練圖網(wǎng)絡(luò)模型時(shí)俱两，需要事先將圖數(shù)據(jù)換成...
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用esm模型do蛋白 embeddingGithub官方文檔包含了整個(gè)包的所有代碼及使用方法：Github官方文檔：https://github.com/facebookresearch/esm[https://g...
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GridSearchCV() 與 Pipline相結(jié)合
GridSearchCV()或RandomizedSearchCV()方法的初級(jí)用法見(jiàn)：http://www.reibang.com/writer#/notebooks/5...
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Pipeline 深入解讀及實(shí)驗(yàn)
一、Pipeline基本知識(shí) Pipeline 對(duì)象將不同計(jì)算步驟串聯(lián)起來(lái)執(zhí)行曹步，方便宪彩、快速、統(tǒng)一讲婚、保險(xiǎn)尿孔！ 構(gòu)造一個(gè)Pipeline對(duì)象時(shí)，需要輸入一個(gè)由多個(gè)二元tuple構(gòu)成...
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GridSearchCV()和RandomizedSearchCV()參數(shù)搜索
一筹麸、具體例子見(jiàn)（jupyter notebook）： E:\cgx硬盤(pán)\★Python and AI\（cgx★★）scikit learn 學(xué)習(xí)筆記\sklearn_cgx...
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numpy 打印輸出格式
為了隨心所欲地打印numpy數(shù)組活合，可以使用numpy的set_printoptions()方法; 參數(shù)說(shuō)明： precision：輸出float型時(shí)，小數(shù)點(diǎn)后保留的位數(shù)物赶； t...
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jupyter notebook 改變主題背景方法最基本步驟： 在cmd中執(zhí)行 1） 安裝jupyter-themes 2） 查看有哪些主題 如果jt命令不存在：https://cloud.tencent.com/devel...
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一個(gè)cell多個(gè)輸出白指，不依靠print()
設(shè)置一個(gè)cell多個(gè)輸出，不用print()也行酵紫。 jupyter notebook 的一個(gè)cell中告嘲，如果直接寫(xiě)多個(gè)對(duì)象，則只有最后一個(gè)對(duì)象會(huì)被輸出奖地，前面變量不會(huì)被輸出： ...
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Git Github使用入門(mén)（說(shuō)明：本文以windows系統(tǒng)為例進(jìn)行說(shuō)明橄唬，linux系統(tǒng)中使用類(lèi)似；本文腳本都在本地Git Bash中執(zhí)行参歹；本文主要講Git仰楚、Github的入門(mén)級(jí)使用。） Git是目前世...
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本地pycharm連接遠(yuǎn)程服務(wù)器的python解釋器執(zhí)行代碼https://blog.csdn.net/qq_36667170/article/details/121716527[https://blog.csdn.net/qq_36...