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這個數(shù)據(jù)集有單細(xì)胞和RNAseq的犹褒,20,21,22是單細(xì)胞的完慧,在根據(jù)GSE id自動下載處理GEO數(shù)據(jù)那里下載峻村,中途報錯只下載了這些文件(圖3...
單獨繪制每個基因的feature plot坊萝,里面的unsplit_group_feature_plot拉太長了茶鉴,一組基因的feature plo...
做這一步的時候用7.cell_anno里面的7.cell_anno_scRNAseq_seurat_cluster_res.rds能跑成功缺亮,但是...
質(zhì)控這里根據(jù)大佬提示加了sample,運行會報錯仗哨,圖3是1.seurat下的metadata文件澈侠,圖5是sample_info_sub.csv文件
首先根據(jù)文章作者提供的metadata文件(圖一)劫侧,以及作者的count.txt.gz,隨后讀取成功得到metadata.csv和single ...
利用文章作者提供的count.txt.gz文件和metadata文件成功運行了第一步1.seurat,現(xiàn)在里面的文件是site里面有4種分組烧栋,我...