單獨繪制每個基因的feature plot感帅,里面的unsplit_group_feature_plot拉太長了,一組基因的feature plot拼圖繪制那里的話就是壓的太扁了失球,另外就是單獨繪制每個基因的violin plot,單獨繪制每個基因的box plot還是運行成功沒有圖出來豺撑,我換了一個數(shù)據(jù)集分析了已經黔牵,單細胞的msigdb的gmt基因集通路富集分析那里只有umap的圖,沒有tsne的圖陆错,我在最開始正文想放tsne的圖金赦,這樣子后面通路富集和前面有點矛盾,細胞比例在不同分組中的差異比較建議增加個堆積圖夹抗,有時候這個圖天長正文不好排版,gene_list_heatmap_plot寬度不夠
omicsTools單細胞一些圖優(yōu)化的建議
?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯(lián)系作者
- 文/潘曉璐 我一進店門察蹲,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來催训,“玉大人,你說我怎么就攤上這事漫拭。” “怎么了儿捧?”我有些...
- 正文 為了忘掉前任悉默,我火速辦了婚禮苟穆,結果婚禮上唱星,老公的妹妹穿的比我還像新娘跟磨。我一直安慰自己间聊,他們只是感情好,可當我...
- 文/花漫 我一把揭開白布哎榴。 她就那樣靜靜地躺著僵蛛,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪飘言。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上喉酌,一...
- 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼垄提,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了铡俐?” 一聲冷哼從身側響起妥粟,我...
- 正文 年R本政府宣布辜伟,位于F島的核電站,受9級特大地震影響约巷,放射性物質發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜独郎,卻給世界環(huán)境...
- 文/蒙蒙 一廊佩、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧标锄,春花似錦、人聲如沸谓松。這莊子的主人今日做“春日...
- 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至竣贪,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間巩螃,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
推薦閱讀更多精彩內容
- 作者,Evil Genius 今天是令人沉重的一天惹盼,所有的網頁軟件變成了灰色。 昨晚還是看了世界杯手报,日本隊確實值得...
- 最近的技術進步使得能夠在單個細胞中分析全基因組特征陈肛。但是,單細胞數(shù)據(jù)為分析提出了獨特的挑戰(zhàn)句旱,需要開發(fā)專用的方法和數(shù)...
- hello,大家好腥泥,今天我們要繼續(xù)分享單細胞空間聯(lián)合分析的部分,參考文章在High Resolution Sing...
- hello,大家好崖技,今天我們繼續(xù)來分享關于10X空間轉錄組在腫瘤方面的研究,其實也和大家分享過很多次了迎献,強調腫瘤正...
- 原文鏈接: https://www.embopress.org/doi/10.15252/msb.20188746...