Y大寬

比對軟件很多羔砾，首先大家去收集一下，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T偶妖，請統(tǒng)一用hisat2(官網(wǎng)https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...

謝俊飛

火山圖是測序分析報告中最為核心的圖片之一态秧。繪制火山圖的方法有許多，Excel和第三方軟件等扼鞋，本文主要運(yùn)用ggplot2和ggrepel兩個R包演示[1][2]申鱼。橫坐標(biāo)為Fol...

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bedtools intersect可以對兩個基因組特征 (genomic features) 進(jìn)行overlap，找到兩者重合的區(qū)域云头。比如求兩個peaks的交集捐友，或者看很多...

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關(guān)于查找motif溃槐，目前有很多種軟件可以進(jìn)行預(yù)測匣砖。我所在的實(shí)驗(yàn)室通常使用FIMO（MEME套件里的一個），但是有很多文獻(xiàn)里也提到了HOMER這個軟件昏滴，并且不乏一些影響因子很高...

天涯清水

R語言包的安裝 參考文章 在R中大概有幾種包的安裝方式猴鲫。 install.packages()常規(guī)包的安裝 括號里面包的名稱要加英文引號，在列出的CRAN鏡像站點(diǎn)列表中選擇一...

小潔忘了怎么分身

起因 這是一個天朗氣清的日子谣殊。我正無聊的翻看著聊天記錄变隔，突然一道題出現(xiàn)在我的視野里： 圖是這樣的： 思路 1.這圖應(yīng)該是ggplot2，theme_bw主題的箱線圖（geom...