我把這個(gè)思路搬運(yùn)到我的課題里蚯窥，復(fù)現(xiàn)圖如下： 相似度：75%网缝。a和b是用AI畫的，所以今天分享下c和d的代碼 一 差異分析 假設(shè)我們有了這樣的一個(gè)表達(dá)矩陣，叫Expr_all。...
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比較三種機(jī)器學(xué)習(xí)模型（隨機(jī)森林窟绷，支持向量機(jī)，邏輯回歸）的分類效果 -
【R>>MOVICS】多組學(xué)+亞型秘密武器MOVICS包整合多組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析惊畏，其安裝的過(guò)程太讓人心酸是牢，大家安裝的過(guò)程慢慢體會(huì)，下面就來(lái)學(xué)習(xí)下這個(gè)由“大魚海棠”老師開發(fā)的R包吧陕截。 1.示例數(shù)據(jù) brca.tcga.R...
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[R語(yǔ)言] ggplot2包 可視化《R for data science》 1《R for Data Science》第二、三章 Data visualisation 啃書知識(shí)點(diǎn)積累 參考書籍《R for data science》《R數(shù)據(jù)科學(xué)》The...
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2023-03-15可變剪接內(nèi)容學(xué)習(xí) 概念 可變剪接（Alternative Splicing，AS）是指從一個(gè)mRNA前體中通過(guò)不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點(diǎn)組合）產(chǎn)生不同的mRNA剪接異...
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gtex數(shù)據(jù)下載和整理數(shù)據(jù)下載 官網(wǎng)訪問(wèn)有障礙驻债，直接去xena吧乳规。 1.讀取表達(dá)矩陣 2. 讀取注釋信息 3.表達(dá)矩陣和臨床信息對(duì)應(yīng)起來(lái) 4. 單基因表達(dá)量畫圖 5.兩個(gè)基因的相關(guān)性圖 6.炫酷的...
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實(shí)戰(zhàn)-TCGA數(shù)據(jù)的NMF聚類和可視化0.NMF NMF是非負(fù)矩陣分解，也是常用的劃分亞組（亞型）的聚類方法之一咯合呐。 代碼主要參考了幫助文檔和曾老板的博客：http://www.bio-info-trainee....
