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隨機森林otu_forest <- randomForest(time ~ ., data = otu, importance = TRUE, ...
corralation 0.輸入數(shù)據(jù)和R包 2.任意兩個基因的相關性分析 2.1 簡單繪圖 使用ggpbur彰触。 2.2 按照stage分組 不僅...
任意基因的任意分組比較 0.輸入數(shù)據(jù) 這里面的數(shù)據(jù): exp是tumor-normal都有的表達矩陣沐旨,exprSet是只有tumor樣本的表達矩...
signafiture 0.R包 1.讀取突變數(shù)據(jù)maf 是和上一篇一樣的數(shù)據(jù)壁袄,從gdc下載的maf文件和臨床信息 2.制作signatures...
maftools 變異數(shù)據(jù)處理的總體思路如下: 思維導圖 1.數(shù)據(jù)下載 TCGA的突變數(shù)據(jù)有4個軟件得到的不同版本: 這個可以在gdc的官網(wǎng)上找...
1.準備輸入數(shù)據(jù) 2.挑選感興趣的基因構建coxph模型 用survival::coxph()函數(shù)構建模型 3.模型可視化-森林圖 4.模型預測...