轉(zhuǎn)錄組測(cè)序目前主要有兩種形式，RNA-seq和microarry。這兩種技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)在GEO數(shù)據(jù)庫中都有很多我抠，其中RNA-seq的數(shù)據(jù)大多是已經(jīng)注釋過的symbol為行名的...
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生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM牙肝，F(xiàn)PKM相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉(zhuǎn)錄組時(shí)卢厂，都是在公司做測(cè)序旭从，然后數(shù)據(jù)也交給公司分析错维，又然后华嘹，期待做個(gè)差異分析吧趣，得出像下圖那么完美的熱圖。 然而耙厚，然而强挫，，我們得...
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定量免疫浸潤在單細(xì)胞研究中的應(yīng)用最近聽說定量免疫浸潤很火颜曾，于是我也報(bào)名參加了果子老師的課程纠拔，跑了幾個(gè)R包，你比如說xCell啊泛豪，GSVA啊稠诲，MCPcounter啊侦鹏，ConsensusTME，ImmuneSu...
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TCGA轉(zhuǎn)錄組差異分析后多種基因功能富集分析：從GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID轉(zhuǎn)換）測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
