小陳生信日記 - 簡(jiǎn)書(shū)

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mummer進(jìn)行基因組間的比對(duì)
下載mummer假哎，并添加到環(huán)境變量 wget https://gigenet.dl.sourceforge.net/project/mummer...

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bam文件
BAM 文件是一種存儲(chǔ)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)結(jié)果的二進(jìn)制格式妓湘。統(tǒng)計(jì) Reads 數(shù)量要獲得 BAM 文件中的 reads（reads 通常指單個(gè)...

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基因組簡(jiǎn)單組裝
1.PacBio HiFi長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù) 長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序能夠檢測(cè)長(zhǎng)度為1,000到20,000個(gè)堿基或更長(zhǎng)的DNA（或RNA）片段。這些片段通常來(lái)自...

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教你在linux系統(tǒng)安裝java——2分鐘極速版
下載地址 Java Downloads | Oracle[https://www.oracle.com/java/technologies/do...

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測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估
1.覆蓋深度 mapping depth 基因組被測(cè)序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強(qiáng)度有多大？每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測(cè)...

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shell腳本統(tǒng)計(jì)reads數(shù)量和堿基數(shù)量
1.github下載命令 git clone 【網(wǎng)頁(yè)】 2.安裝miniconda wget https://mirrors.tuna.tsin...

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imageJ 測(cè)量圖片中物體的長(zhǎng)度
設(shè)置一個(gè)比例尺：像素：長(zhǎng)度呀打。就可以測(cè)量了矢赁。

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克隆數(shù)據(jù)上傳genbank

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測(cè)序數(shù)據(jù)上傳SRA數(shù)據(jù)庫(kù)
1.先創(chuàng)建一個(gè)bioproject submitter 2.選擇數(shù)據(jù)的類(lèi)型 3.填寫(xiě)采集樣品的名稱 4.第5、6贬丛、7項(xiàng)直接跳過(guò)

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