mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系統(tǒng)的terminal枢赔！ 盡管TCGA數(shù)據(jù)庫中已經(jīng)提供了大量的處理好的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù)，但是無論是自身實驗需要，還是從NCBI的GEO...
發(fā)簡信
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mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipeline -
RNA-seq(7): DEseq2篩選差異表達(dá)基因并注釋(bioMart)============================================寫在前面：可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做缅茉？[https://www.jians...
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使用modeltest-ng和raxml-ng構(gòu)建ML系統(tǒng)發(fā)育樹
雖然簡單，但絕對首發(fā)……該給自己的系統(tǒng)發(fā)育構(gòu)建流程升級了纯蛾，新版本軟件不僅速度快幸逆，而且對用戶友好！ modeltest-ng 的速度是真的飛快闰渔！modeltest-ng 和 r...
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IQ-TREE最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的神器IQ-TREE：最大似然法構(gòu)建精確席函、快速、靈活冈涧、廣泛的系統(tǒng)發(fā)育樹 IQ-TREE自2011年就已經(jīng)開發(fā)并開源茂附，至今都有專業(yè)團(tuán)隊維護(hù)，其名字來源于IQPNNI和TREE-PUZ...
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如何對基因組序列進(jìn)行注釋基因組組裝完成后督弓，或者是完成了草圖营曼，就不可避免遇到一個問題，需要對基因組序列進(jìn)行注釋愚隧。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型蒂阱，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
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「學(xué)轉(zhuǎn)錄組入門生信」第一周從環(huán)境配置開始
我們第一周目標(biāo)有三個: 熟悉Linux環(huán)境登錄服務(wù)器Linux基本命令PATH的意義 學(xué)習(xí)conda管理環(huán)境如何在conda中添加channel如何用conda安裝和卸載軟件...
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學(xué)習(xí)生物信息，我都應(yīng)該掌握那些內(nèi)容狂塘？持續(xù)更新ing.....最后更新時間：2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux的權(quán)限 權(quán)限： eg： 7=4+2+1 #代表w+r+x權(quán)限...
