UpSetR的意義 做Venn圖,在4個(gè)以下有較好的效果,而花瓣圖則信息量較低,現(xiàn)在找到一種叫做UpSetR圖(是這么叫嗎能扒?看了兩篇文章都是這么叫)的方法,可以很好地替代花瓣...
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DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://www.biostars.org/p/357464/]說(shuō)來(lái)也神...
在正式開(kāi)始操作前做了一些資料的收集辫狼,正好搜到了18級(jí)學(xué)姐的CSDN文章初斑,從她的作業(yè)流程中參考了很多↓ 用Bionconductor的affy包處理.cel文件_affy包怎么...
事情的起因 我有一個(gè)IKBC的機(jī)械鍵盤(pán),當(dāng)時(shí)買(mǎi)的時(shí)候只想要一個(gè)打字輕松又不能太貴的鍵盤(pán)膨处,于是買(mǎi)了IKBC的C104见秤。 但是由于Mac系統(tǒng)與Windows系統(tǒng)的差異,所以每次按...
我最近開(kāi)發(fā)的一個(gè)R包被CRAN接收了真椿,發(fā)布在:https://cran.rstudio.com/web/packages/chromseq/index.html 主要參考的文...
寫(xiě)在前面 可能第一眼看到這個(gè)標(biāo)題大家都會(huì)很奇怪鹃答,因?yàn)?G內(nèi)存的服務(wù)器還要分析上游的話,不太可能突硝,確實(shí)在中間我把比對(duì)的過(guò)程跳過(guò)了服務(wù)器生信分析平臺(tái)配置參考https://zhu...
在做limma分析過(guò)程中测摔,又出現(xiàn)了報(bào)錯(cuò)信息 Error in makeContrasts(contrasts = c(pccp_comp), levels = pccpdes...
做批量單因素cox回歸分析時(shí)在網(wǎng)上找到了現(xiàn)成的代碼,但是做批量Logistic回歸分析時(shí)網(wǎng)上沒(méi)有找到可用的代碼解恰,自己結(jié)合網(wǎng)上教程實(shí)現(xiàn)了批量單因素Logistic回歸分析锋八,在這...
Seurat Weekly NO.0 || 開(kāi)刊詞Seurat Weekly NO.1 || 到底分多少個(gè)群是合適的护盈?挟纱! 在過(guò)去的一周里Seurat社區(qū)在github總提問(wèn)數(shù)...
言簡(jiǎn)意賅
Linux010 Miniconda安裝及使用簡(jiǎn)介 Conda 是一個(gè)開(kāi)源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng),可以在多個(gè)操作系統(tǒng)上(包括 Linux腐宋,Mac OSX 和 Windows)使用樊销,Conda 允許用戶可以從不同的...
簡(jiǎn)介 Conda 是一個(gè)開(kāi)源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng),可以在多個(gè)操作系統(tǒng)上(包括 Linux脏款,Mac OSX 和 Windows)使用围苫,Conda 允許用戶可以從不同的...
1.conda安裝 詳見(jiàn):Linux009 Miniconda安裝生信軟件 2.使用Miniconda安裝fastqc 3.下載測(cè)試數(shù)據(jù) sra toolkit:Linux0...
1. The Holm-Sidak Test can be used for both pairwise comparisons and comparisons versus...
下載TCGA數(shù)據(jù)的方法有很多募强,上一篇介紹了如何用gdc-client批量下載數(shù)據(jù)株灸,基于網(wǎng)上有很多用TCGAbiolinks包下載數(shù)據(jù)的教程,所以也想學(xué)習(xí)一下這個(gè)方法擎值。TCGA...