你這也不是單細(xì)胞呀利术，ssGSEA吧
利用單細(xì)胞集合做免疫浸潤分析以前一直用經(jīng)典的MCP法分免疫浸潤 總感覺不好 上篇文章上也寫過 這次用腸癌單細(xì)胞6萬多的細(xì)胞的特異性基因，特異性基因我是一個(gè)一個(gè)看的低矮，我選的標(biāo)準(zhǔn)是logfc大于1印叁，而且如果...
發(fā)簡信
IP屬地：陜西
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公眾號(hào): 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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現(xiàn)在這個(gè)包好像R包好像有點(diǎn)問題轮蜕，處理數(shù)據(jù)的時(shí)候回出錯(cuò)
TCGA數(shù)據(jù)挖掘（一）：TCGAbiolinks包介紹
腫瘤基因組圖譜（TCGA）計(jì)劃是由美國National Cancer Institute（NCI）和National Human Genome Research Instit...
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ATAC-Seq 數(shù)據(jù)分析（上）背景： 染色質(zhì)和染色體的結(jié)構(gòu)和功能 每一條染色單體由單個(gè)線性DNA分子組成。細(xì)胞核中的DNA是經(jīng)過高度有序的包裝蝗锥，否則就是一團(tuán)亂麻肠虽，不利于DNA復(fù)制和表達(dá)調(diào)控。這種有序的狀態(tài)...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘（二）：數(shù)據(jù)下載與整理
管于TCGA數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)下載玛追，我們之前有介紹過R語言下載包：R語言TCGA-Assembler包下載TCGA數(shù)據(jù)税课，同時(shí)在介紹數(shù)據(jù)庫的使用教程中也介紹了在線下載以及官方下載工...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘（一）：TCGAbiolinks包介紹
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生信技能樹韩玩，生信菜鳥團(tuán)，jimmy
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醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)文獻(xiàn)第2期：腫瘤微環(huán)境
? 腫瘤內(nèi)刺激樹突狀細(xì)胞(SDC)在刺激細(xì)胞毒性T細(xì)胞和誘導(dǎo)抗腫瘤免疫反應(yīng)中起著重要的作用陆馁。了解調(diào)節(jié)它們?cè)谀[瘤微環(huán)境(TME)中的豐度的機(jī)制可以揭示新的治療機(jī)會(huì)找颓。作者發(fā)現(xiàn)，在...
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