今天跟大家分享的工具可以是用來(lái)處理帶有分子標(biāo)簽(Unique Molecular Identifiers者冤，UMIs)和細(xì)胞條形碼(cell ba...
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umi_tools for dealing with UMIs and cell barcodes -
MetaCell： scRNAseq聚類和細(xì)胞類型注釋的R包??為了更好的展示代碼项栏，我把之前的帖子重新整理成markdown的格式，方便大家觀看Ｎ禾獭！难咕！ ??scRNAseq可謂是目前科研界研究細(xì)胞異質(zhì)性的...
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markdown： 你值得擁有的輕量級(jí)標(biāo)記語(yǔ)言??Markdown是一種輕量級(jí)標(biāo)記語(yǔ)言峰弹，內(nèi)容是代碼與文本的混合，類似且兼容HTML大年，但語(yǔ)法比HTML簡(jiǎn)單换薄。學(xué)起來(lái)很簡(jiǎn)單，基本沒(méi)有什么障礙翔试，學(xué)會(huì)...
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NCBI下載SRA數(shù)據(jù)的4種方法??作為生命科學(xué)的從事者轻要，不論是老師或者學(xué)生都應(yīng)該用過(guò)NCBI((National Center for Biotechnology Infor...
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html如何給圖片添加動(dòng)態(tài)的文字說(shuō)明
前言 ??之前發(fā)過(guò)一個(gè)html5的學(xué)習(xí)帖子《html5 學(xué)習(xí)總結(jié)》，帖子內(nèi)容主要是介紹一些html的基礎(chǔ)概念和注意事項(xiàng)如盒子模型垦缅、高度塌陷問(wèn)題伦腐。...
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metacell： scRNAseq聚類和細(xì)胞類型注釋的R包
scRNAseq可謂是目前科研界研究細(xì)胞異質(zhì)性的有效手段，正處于如火如荼的階段失都。單細(xì)胞分析一個(gè)很重要目的就是為了確定細(xì)胞的類型柏蘑。說(shuō)到單細(xì)...
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Viral-Track： 揭示重癥COVID-19病人的感染特征前言 ??今年的新冠可謂是來(lái)得觸不及防幸冻，對(duì)各個(gè)行業(yè)多帶來(lái)了很大的影響。慶幸的是在全國(guó)人民一起配合的努力下咳焚，國(guó)內(nèi)的疫情被控制的很好洽损，相比于海外來(lái)說(shuō)...
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python腳本截取fastq序列
前言 ??最近在學(xué)習(xí)單細(xì)胞方面的知識(shí)，遇到了一個(gè)小的需求就是截取需要的fastq序列革半。先來(lái)說(shuō)一下為什么有這個(gè)需求碑定，一般來(lái)說(shuō)單細(xì)胞的測(cè)序文件有三個(gè)...
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R： 向量(vector)元素操作總結(jié)
??R語(yǔ)言中的向量可以說(shuō)是經(jīng)常使用到的數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)類型，所以總結(jié)了一下向量的相關(guān)操作又官，包含創(chuàng)建延刘、訪問(wèn)、插入和刪除六敬、修改值等碘赖。 1、向量的創(chuàng)建 這里介...
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scRNAseq：h5文件轉(zhuǎn)化為matrix表達(dá)矩陣前言 ??今天想跟大家分享一下單細(xì)胞分析中的一個(gè)需求外构，就是如何將h5的表達(dá)量文件轉(zhuǎn)化為常見(jiàn)的表達(dá)矩陣普泡。大部分情況下，我們是不需要用到這個(gè)需求审编，因...
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