240 發(fā)簡信
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    FeaturePlot 對負(fù)值并不友好

    ??Seurat的FeaturePlot可以展示基因在降維空間里各個(gè)分群的表達(dá)情況刺啦,也可以展示metadata里面的數(shù)據(jù)情況踊赠,例如基因集打分情況...

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    riborex:差異翻譯基因分析

    ??分析差異翻譯基因時(shí)子房,為了保證結(jié)果的正確性付呕,除了使用Xtail軟件外延曙,也用riborex分析了一遍芹务,該軟件封裝了常規(guī)轉(zhuǎn)錄組常用的三種差異分析框...

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    Tips:ChIPseeker注釋的peak文件不要隨意命名

    ??ChIPseeker用來做peak注釋體驗(yàn)感確實(shí)很好蝉绷,所以也經(jīng)常用,為此還特意包裝了一個(gè)性化腳本方便命令行直接使用枣抱,后臺也有不少人獲取腳本熔吗,...

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    xtail | 差異翻譯基因分析

    ??基因翻譯,即遺傳密碼從轉(zhuǎn)錄本到蛋白質(zhì)的過程佳晶,也是功能基因能夠發(fā)揮自身作用前的必經(jīng)之路桅狠。基因的翻譯效率收到很多因素的調(diào)控轿秧,這其中最直接的是基因...

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    ChIPseeker個(gè)性化注釋腳本修復(fù)

    ??之前的推文[個(gè)性化ChIPseeker注釋peak結(jié)果[http://www.reibang.com/p/f1307325d8a2]]里面...

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    TCellSI:巧用housekeeping genes矯正樣本間效應(yīng)

    ??TCellSI:一款借助Mann-Whitney U統(tǒng)計(jì)量中跌,通過特定marker基因集和背景基因,對T細(xì)胞狀態(tài)進(jìn)行評估打分的軟件菇篡。該軟件能夠...

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    PCA:這樣應(yīng)該懂了吧漩符!

    ??在RNA-seq分析結(jié)果中經(jīng)常會(huì)看到由兩個(gè)主成分(PC1,PC2)繪制的PCA (principal component analysis)...

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    R tips:Seurat應(yīng)該這么讀取多樣本

    "槍響了""看到是誰開的槍了嗎""看不清逸贾,他站在道德的制高點(diǎn)上陨仅,他在陽光下。"????????????????????——溫特伯格《狩獵》 ??...

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