注:本文全文摘選自知乎:fastp: 一款超快速全功能的FASTQ文件自動(dòng)化質(zhì)控+過(guò)濾+校正+預(yù)處理軟件 1引言 各位做生信的小伙伴都知道社痛,對(duì)于...
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劉小澤寫(xiě)于19.10.28 相信大家都遇到過(guò)厨内,這個(gè)煩人的loading~ 這是因?yàn)镮GV的設(shè)計(jì)者默認(rèn)全球都能訪(fǎng)問(wèn)他們的網(wǎng)站踩寇,但是醉旦,廣大的國(guó)內(nèi)用戶(hù)...
之前分析過(guò)的測(cè)序數(shù)據(jù)雇毫,數(shù)據(jù)質(zhì)量都很好,給了我一個(gè)錯(cuò)覺(jué)質(zhì)控的前后差別不是很大喂柒,內(nèi)心里對(duì)質(zhì)控這一步也就不是很重視不瓶,跑完質(zhì)控有時(shí)也懶得看結(jié)果,拿到一批...
BWA[http://bio-bwa.sourceforge.net/] (Burrows-Wheeler Aligner) BWA主要是將re...
Samtools和Bcftools簡(jiǎn)介 SAMtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具合集胳喷,包含有許多命令湃番。BCFtools主要是用來(lái)操...
Samtools常用命令的總結(jié)【samtools強(qiáng)大工具的幾個(gè)功能】 內(nèi)容來(lái)自一下網(wǎng)址,感謝原作者吭露。不是盜版吠撮,記錄僅用于個(gè)人學(xué)習(xí),有筆記可尋!泥兰!...
參考文章:https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6805373.html1弄屡、view主要功能:sam和bam...
必須學(xué)習(xí)這篇英文:http://www.htslib.org/doc/samtools.html【繼續(xù)更新ing】 samtools view ...
SAM(sequence Alignment/mapping)數(shù)據(jù)格式是目前高通量測(cè)序中存放比對(duì)數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)格式,當(dāng)然他可以用于存放未比對(duì)的數(shù)據(jù)鞋诗。...
Source: https://blog.csdn.net/Longyan_sysu/article/details/52184628作者:龍炎...