我們已經(jīng)知道scanpy是一個(gè)由Python組織的功能強(qiáng)大的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析工具，用的順手的同時(shí)启具，我們不禁要問(wèn)：她是如何組織的斟珊？ 于是，我們嘗試閱...

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scanpy軟件官網(wǎng)：https://scanpy-tutorials.readthedocs.io/en/latest/pbmc3k.html...

和Seurat一樣堵漱，Scanpy也提供了多樣本空轉(zhuǎn)數(shù)據(jù)的整合https://scanpy-tutorials.readthedocs.io/en...

將空間位置信息和轉(zhuǎn)錄組分析相結(jié)合，對(duì)于癌癥涣仿、免疫勤庐、腫瘤免疫相互作用，組織微環(huán)境好港，神經(jīng)和發(fā)育等領(lǐng)域愉镰，有著令人期待的應(yīng)用前景。 單細(xì)胞的一切分析钧汹，加...

處理單細(xì)胞不可避免的一個(gè)問(wèn)題就是樣本整合問(wèn)題丈探。那如何將不同器官，不同測(cè)序平臺(tái)拔莱，不同物種之間的單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析呢碗降？Scanpy使用pytho...

什么是擬時(shí)序分析？擬時(shí)序（pseudotime）分析塘秦，又稱細(xì)胞軌跡（cell trajectory）分析讼渊，通過(guò)擬時(shí)分析可以推斷出發(fā)育過(guò)程細(xì)胞的分...