Introduction 宏基因組學(xué)是直接從環(huán)境樣本（如土壤、水、腸道內(nèi)容物等）中回收遺傳物質(zhì)并進(jìn)行研究的學(xué)科栋盹，無需對個(gè)體生物進(jìn)行分離或培養(yǎng)焰络。這...

Introduction 上一篇里通過Metabat2了解了宏基因組分箱的關(guān)鍵步驟胧后，這篇文章將介紹一個(gè)更全面的binning流程：MetaWRA...

上次已經(jīng)介紹過了使用R繪制系統(tǒng)發(fā)育樹的基本用法[http://www.reibang.com/p/b6c4d3376bc9]尊沸，也埋下一個(gè)小坑：...

Logs 增加R包pctax內(nèi)的一些幫助上游分析的小腳本（2024.03.03） 增加Mmseqs2用于去冗余，基因聚類的速度非掣径啵快伤哺，且隨序列量...

Introduction ANI 是指平均核苷酸一致性（Average Nucleotide Identity），它是一種用來比較兩種基因組之間...

Introduction GTDB（Genome Taxonomy Database）是一個(gè)專注于基因組分類學(xué)的數(shù)據(jù)庫者祖，旨在提供高質(zhì)量的細(xì)菌立莉、古...

Introduction 在生物信息學(xué)領(lǐng)域，對（宏）基因組進(jìn)行生物合成基因簇（BGCs）的挖掘七问，編碼次生代謝產(chǎn)物的生產(chǎn)已成為自然產(chǎn)物發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵策...

Introduction 了解控制群落多樣性蜓耻、功能、演替和生物地理學(xué)的機(jī)制是生態(tài)學(xué)械巡，尤其是微生物生態(tài)學(xué)中的一個(gè)核心刹淌。推薦閱讀綜述： Zhou, ...

Introduction 上次簡要介紹過了微生物組中生物合成基因簇（BGCs）分析[https://mp.weixin.qq.com/s/4eH...

我們實(shí)驗(yàn)室的子諾師姐開發(fā)了一種新型的用于個(gè)體生物和化學(xué)暴露組縱向測繪的可穿戴被動采樣器：AirPie。目前可以在一個(gè)驅(qū)蚊扣差不多大小的devic...