Introduction 分享一些R進(jìn)階使用的技巧题暖，相當(dāng)于是之前寫的R語(yǔ)言學(xué)習(xí)[../r-learning]的實(shí)踐和總結(jié)了絮宁。 Online sl...

Introduction TaxonKit[https://bioinf.shenwei.me/taxonkit/chinese/]是一個(gè)用于處...

Introduction 上一篇里通過Metabat2了解了宏基因組分箱的關(guān)鍵步驟梆暮，這篇文章將介紹一個(gè)更全面的binning流程：MetaWRA...

Introduction 宏基因組學(xué)是直接從環(huán)境樣本（如土壤、水绍昂、腸道內(nèi)容物等）中回收遺傳物質(zhì)并進(jìn)行研究的學(xué)科惕蹄，無(wú)需對(duì)個(gè)體生物進(jìn)行分離或培養(yǎng)。這...

上次已經(jīng)介紹過了使用R繪制系統(tǒng)發(fā)育樹的基本用法[http://www.reibang.com/p/b6c4d3376bc9]治专，也埋下一個(gè)小坑：...

Introduction 我們?cè)谧錾镄畔⒎治鰰r(shí)卖陵，對(duì)于大規(guī)模的上游數(shù)據(jù)的處理，一般需要在大型服務(wù)器或集群上進(jìn)行张峰。我最早接觸并使用的是一個(gè)基于SL...

Logs 增加R包pctax內(nèi)的一些幫助上游分析的小腳本（2024.03.03） 增加Mmseqs2用于去冗余泪蔫，基因聚類的速度非常快喘批，且隨序列量...

Introduction ANI 是指平均核苷酸一致性（Average Nucleotide Identity）撩荣，它是一種用來(lái)比較兩種基因組之間...

Introduction GTDB（Genome Taxonomy Database）是一個(gè)專注于基因組分類學(xué)的數(shù)據(jù)庫(kù)，旨在提供高質(zhì)量的細(xì)菌饶深、古...