在研究基因表達(dá)譜或者蛋白表達(dá)譜時并巍，經(jīng)常會涉及到對時間序列的分析赊颠。例如焕济，不同的基因或蛋白表達(dá)水平隨時間表現(xiàn)出怎樣的動力學(xué)特征，怎樣挖掘潛在的時間特...

導(dǎo)讀 circlize包中circos.heatmap繪制圓版熱圖玖姑，circos.track可追加更多圖形成組合圖。 修改自：https://j...

TCseq包提供了一個統(tǒng)一的套件去處理不同時序類型的數(shù)據(jù)分析，可以應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄組或者像ATAC-seq疮鲫，Chip-seq的表觀基因組時序型數(shù)據(jù)分析...

上一節(jié)介紹了組內(nèi)相關(guān)性熱圖的繪制，這一節(jié)來介紹組間相關(guān)性熱圖弦叶，即由2組數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性俊犯，廢話不多說直接看代碼喜歡可以關(guān)注公眾號R語言數(shù)據(jù)分析指南...

相關(guān)性熱圖，顧名思義就是根據(jù)數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性系數(shù)來繪制熱圖伤哺，可分為2類：組內(nèi)相關(guān)性熱圖與組間相關(guān)性熱圖 組內(nèi)相關(guān)性熱圖燕侠，即由一組數(shù)據(jù)內(nèi)部的相關(guān)性...

ggcor包最初是因為能快速實現(xiàn)19年Science一組合相關(guān)性圖(上圖所示)變得流行起來，除此該包對熱圖立莉、熱圖等等的可視化都是很方便快捷的绢彤，除...

scRNAseq可謂是目前科研界研究細(xì)胞異質(zhì)性的有效手段，正處于如火如荼的階段蜓耻。單細(xì)胞分析一個很重要目的就是為了確定細(xì)胞的類型茫舶。說到單細(xì)...

雙向富集分析圖 1.需求 上下調(diào)基因分別富集分析媒熊，把結(jié)果放在一張圖上: 2.示例數(shù)據(jù)和r包準(zhǔn)備 模擬的是kegg的富集結(jié)果奇适，編了一個數(shù)據(jù)坟比。p是p...

我們在采用monocle做細(xì)胞擬時序分析的時候，常常會不滿意于原圖的配色嚷往，而軟件自帶的配色是根據(jù)降維后分出的cell type進(jìn)行顏色的分類的 ...