adonis文檔：https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/to...

導(dǎo)讀 用Metabat2分箱的方法見：宏基因組分箱（二）Metabat2分箱實(shí)戰(zhàn)[http://www.reibang.com/p/72a60...

R Markdown 是Markdown在R中的延伸氏义。除了具備一般Markdown 語法功能之外锄列，最關(guān)鍵的是可以在Rmarkdown 中插入代碼...

熱圖（heatmap）在生信領(lǐng)域基本就是常規(guī)操作，基本技能惯悠，入門操作邻邮。能畫熱圖的工具也有很多，我自己常用的R包是pheatmap吮螺。 最近經(jīng)橙那簦看見...

今天分享另外一個(gè)最近學(xué)習(xí)的一個(gè)畫圖的小技巧。 說到網(wǎng)絡(luò)圖的繪制鸠补，大家可能首先想到的是Cytoscape萝风，它在生物學(xué)相關(guān)的領(lǐng)域應(yīng)用非常廣泛，我自己...

晒娑瑁基圖，其實(shí)我用的不太多泉蝌。最近常見還是在分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)的時(shí)候歇万，展示細(xì)胞通訊用的比較多的一種類型的圖。例如下面一張就是cellchat畫的一張裳悖基...

本想著寫一篇介紹論文中各種類型圖表的推送贪磺，但是著筆介紹時(shí)又覺得不如一起繪圖吧！各類學(xué)術(shù)圖表都萬變不離其宗诅愚，以圖的形式將處理后的數(shù)據(jù)展示出來（主要...

前面一個(gè)帖子我們學(xué)習(xí)了畫基本的PCA圖形寒锚，但是是二維的，今天我們學(xué)習(xí)繪制三維的违孝，因?yàn)樵谟行﹑aper中看到作者放的是三維的刹前，其實(shí)也挺好看的。主成...

前面雌桑，我們仔細(xì)學(xué)習(xí)了Alpha多樣性的一些常見指數(shù)喇喉，今天我們嘗試用R來計(jì)算這些常用指數(shù)。 library(vegan) library(pica...