有效降維對于scRNA-seq分析至關(guān)重要。主成分分析（PCA）被廣泛使用，但需要連續(xù)的、正態(tài)分布的數(shù)據(jù)；因此，它經(jīng)常與scRNA-seq應(yīng)用中...

前言 說到對單細(xì)胞亞群進行定義，那對很多分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)的小伙伴來說都是最頭疼的事情之一了治专。因為定義細(xì)胞的正確與否直接關(guān)系到后續(xù)分析所有結(jié)果的準(zhǔn)確...

1. 數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備 2.預(yù)測細(xì)胞通信 在比較多種生物條件下的細(xì)胞-細(xì)胞通信時，可以得知細(xì)胞通信是否增強遭顶；細(xì)胞類型顯著變化之間的相互作用张峰；不同條件下...

單細(xì)胞測序方法和原理系列： 1. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組建庫原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jia...

scRNAseq免疫細(xì)胞注釋： 免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞[http://www.reibang.com/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)...

作者：堯小飛審稿：童蒙編輯：angelica 引言 隨著單細(xì)胞技術(shù)的發(fā)展棒旗，獲得單細(xì)胞數(shù)據(jù)越來越成為可能喘批，隨著單細(xì)胞數(shù)據(jù)的增多，單細(xì)胞亞群的鑒定越...

scRNAseq免疫細(xì)胞注釋： 免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞[http://www.reibang.com/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)...

0. 概述 Cell Ranger 是 10X genomics 官方提供的一套針對單細(xì)胞 RNA 測序輸出結(jié)果進行比對嗦哆、定量谤祖、聚類及基因表達分...

前言 Immugent在之前的一篇推文：ProjecTILs：一站式解決腫瘤和感染模型中T細(xì)胞的注釋[https://mp.weixin.qq....