單細(xì)胞測(cè)序方法和原理系列:
- 1. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組建庫(kù)原理:SMART、TargetAmp和10X genomics
- 2. DNA文庫(kù)構(gòu)建和Illumina測(cè)序化學(xué)原理
- 3. 單細(xì)胞免疫組庫(kù):TCR基因重排原理和TCR測(cè)序建庫(kù)方法
- 4. 單細(xì)胞ATAC-seq原理介紹與報(bào)告解讀
- 5. CITE-seq:同時(shí)測(cè)細(xì)胞表面蛋白和RNA的單細(xì)胞測(cè)序
1. 文章
LIBRA-seqs全稱Linking B cell Receptor to Antigen specificity through sequencing细移,意思是通過(guò)測(cè)序?qū)細(xì)胞受體與抗體特異性連接搏予。
這項(xiàng)技術(shù)的方法學(xué)的文章在2017年發(fā)表在cell上。
特點(diǎn):
2. 方法原理
- 2.1 對(duì)抗原加標(biāo)簽
在抗原上連接上PE燃料,用于流式分選,連接上特定DNA條碼简十,用于測(cè)序册招。(這里的抗原就像魚(yú)餌,每種魚(yú)餌可以抓特定的魚(yú)。給魚(yú)餌加上標(biāo)簽,就可以知道抓到的是什么魚(yú))
- 2.2 把外周血單核細(xì)胞與抗原孵育
- 2.3 流式細(xì)胞儀分離帶熒光的細(xì)胞
- 2.4 通過(guò)10x儀器,把細(xì)胞分離再測(cè)序
- 2.5 經(jīng)過(guò)基因重組表達(dá)旬牲,得到目標(biāo)抗體
3. LIBRA-seq優(yōu)點(diǎn)
傳統(tǒng)方法:雜交瘤技術(shù)和噬菌體展示技術(shù)
和傳統(tǒng)方法相比,LIBRA-seq具有如下優(yōu)點(diǎn):
- 速度快
- 可用于被感染過(guò)的搁吓,有免疫力的人的外周血
- 一次性得到目標(biāo)抗原原茅、抗體 輕重鏈的全場(chǎng)序列
- 可以一次實(shí)驗(yàn)篩選多個(gè)抗原
- LIBRA-seq得分直接顯示了抗體的結(jié)合特異性