如果根據(jù)SNP或者Indel 構(gòu)建其系統(tǒng)進化樹摘完,可以展示群體中不同個體的相互關(guān)系斑响,基因變異相似的往往會在同一個樹的cluster中润绵,一顆好的樹可...
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如果根據(jù)SNP或者Indel 構(gòu)建其系統(tǒng)進化樹摘完,可以展示群體中不同個體的相互關(guān)系斑响,基因變異相似的往往會在同一個樹的cluster中润绵,一顆好的樹可...
今天給大家推薦一個網(wǎng)站老充,該網(wǎng)站為我們提供了數(shù)據(jù)可視化的多種形式福侈。 網(wǎng)站的名字叫做r-graph-gallery,具體的網(wǎng)址:https://ww...
pheatmap參數(shù): 網(wǎng)上有針對熱圖繪制的粗略講解谈飒,但是都是參數(shù)不完整岂座,可能不能滿足所有人需求,于是手動整理了熱圖的全參數(shù)介紹杭措。 mat 數(shù)組...
本文我們來簡單介紹一下非撤咽玻快捷好用的一個RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推薦的原因是其速度非橙拷椋快,在我的Mac Pro...
superqun 原創(chuàng)于簡書 手工目錄: Q1:如何在肺癌數(shù)據(jù)庫中選出k-ras突變的病人樣本赘那。 1. 使用GDC下載刑桑。 在GDC portal...
Kallisto下游推薦的分析軟件是Sleuth,所以我們本次介紹如何使用Sleuth進行相關(guān)的分析募舟。 RNA-seq在完成轉(zhuǎn)錄本的鑒定及定量后...
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做微生物16S測序的時候拱礁,公司的報告里經(jīng)常會給到兩種檢驗Adonis和ANOSIM琢锋,聽過t.test、wilicox呢灶、anova各種檢驗吴超,那么A...
GOplot 包通過封裝好的函數(shù)可視化基因功能分析結(jié)果。 #1. 安裝 #2. GOplot 內(nèi)置數(shù)據(jù) ##2.1 腦和心臟內(nèi)皮細胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)...
CPM<-read.table("~/Desktop/OneDrive/GTEx/cpm.tsv",header = T,row.names =...