介紹 一致性聚類是一種為確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的數(shù)量和成員提供定量證據(jù)的方法拟淮，例如作為微陣列基因表達(dá)。這種方法在癌癥基因組學(xué)中得到了廣泛應(yīng)用，在...
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一致性聚類ConsensusClusterPlus -
可視化文章集錦(套路祭饭、配色艺蝴、編輯凸椿、在線工具肠槽、R乡小、CIRCOS阔加、Cytoscape)
數(shù)據(jù)可視化是解析、理解和展示數(shù)據(jù)不可缺少的一部分满钟。炫或不炫看個(gè)人喜好和功底胜榔，能否達(dá)意是最基本的要求---最合適的圖示和配色表達(dá)最直觀的含義。 本...
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定量蛋白組生信分析主要來源于諾禾公司文件學(xué)習(xí)筆記湃番，略有修改夭织，侵權(quán)刪！ 1）蛋白功能注釋 目前提供注釋的通用功能數(shù)據(jù)庫主要有 GO牵辣、KEGG摔癣、COG 等。通過利用這...
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TCGA視頻課程筆記（上）TCGA-101-課程介紹-需要哪些背景知識(shí) 基于TCGA28篇教程 掌握以下基礎(chǔ)知識(shí)： 概念纬向、研究范圍择浊、數(shù)據(jù)來源、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)逾条、數(shù)據(jù)格式琢岩、癌癥相關(guān)...
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通過整合生物信息學(xué)分析辨認(rèn)TNBC的重要基因和通路部分代碼見：http://www.reibang.com/p/3553220509d7原文名稱：Identification of Key G...
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基因家族分析 | 基因家族成員鑒定(hmm模型＆同源blast)方法一：基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件、注釋文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensembl...
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多重檢驗(yàn)的目的和方法
目的： 多次檢驗(yàn)導(dǎo)致的大量假陽性1. 如果是小概率事件（< 5%）师脂，我們就拋棄了最初的美好假設(shè)（H0：沒有差異）担孔，認(rèn)為觀測(cè)的和預(yù)期不一樣（接受H...
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WGCNA典型文章解析及視頻教程WGCNA其譯為加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析江锨。該分析方法旨在尋找協(xié)同表達(dá)的基因模塊(module)，并探索基因網(wǎng)絡(luò)與關(guān)注的表型之間的關(guān)聯(lián)糕篇，以及網(wǎng)絡(luò)中的...
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典型醫(yī)學(xué)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - 數(shù)據(jù)獲取到標(biāo)準(zhǔn)化GEO是當(dāng)今最大啄育、最全的公共基因數(shù)據(jù)資源庫，包括基因的表達(dá)拌消、突變挑豌、修飾等信息，涵蓋幾乎所有的疾病墩崩，且單個(gè)實(shí)驗(yàn)檢測(cè)樣品數(shù)目較多氓英，是我們分析、學(xué)習(xí)的...
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從CNV到FPKMCreate: 2019-03-14 在看CONTRA的腳本鹦筹，了解CNV分析方法铝阐，順帶查找一下其他的CNV分析軟件，就看到了FishingCNV...
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