生信 - 專題

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生信

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Paper 2：轉(zhuǎn)錄組+miRNA+降解組相關(guān)文章
Paper 2：轉(zhuǎn)錄組+miRNA+降解組相關(guān)文章標(biāo)題：Integrated transcriptome, small RNA and deg...

催催莎 0 2
方便快捷的smallRNA數(shù)據(jù)分析流程
前言 ??今天來跟大家分享一個(gè)smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanalyzer.systemsbiol...

1.3 生信云筆記 11 20

Ribo-seq分析必看文獻(xiàn) | 知識(shí)（一）：15年玉米
Ribosome profiling reveals dynamic translational landscape in maize seed...

2.1 熱衷組培的二貨潛 9 29 1
【ChIP-seq 實(shí)戰(zhàn)】五罚渐、合并bam和去除PCR重復(fù)
這里是佳奧筋现！獲得了比對(duì)的bam文件，生成了index的bai文件，生成了比對(duì)結(jié)果stat文件添诉。合并bam文件和去除PCR重復(fù)沒有嚴(yán)格先后順序...

0.3 佳奧 3 5
RNA seq 標(biāo)準(zhǔn)化不同方式
Normalization 差異基因分析工作流程的第一步是計(jì)數(shù)歸一化摧莽，這對(duì)于準(zhǔn)確比較樣品之間的基因表達(dá)是必需的。 RNA-Seq（RNA測(cè)序的縮...

0.1 Gogin的隨筆 0 4
轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)六（reads計(jì)數(shù)與標(biāo)準(zhǔn)化）
轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)一（軟件安裝）轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)二（數(shù)據(jù)下載）轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)三（數(shù)據(jù)質(zhì)控）轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)四（參考基因組及gtf注釋探究）轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)五（...

1.3 Dawn_WangTP 4 42
DESeq2的多組比較
DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://www.biostars.org...

2.1 可能性之獸 7 34

bamtofastq 將bam文件轉(zhuǎn)成fastq文件
目標(biāo) 通常比對(duì)好的bam陨界，如果需要重新比對(duì)巡揍，需要將文件轉(zhuǎn)成原始的測(cè)序文件的格式fastq。通過bedtools中的bamtofastq 能夠?qū)⑽?..

0.7 果蠅的小翅膀 0 8
GSEA結(jié)果解讀
上一篇GSEA可以做什么[http://www.reibang.com/p/1cc9f6c20ef6]之后菌瘪，繼續(xù)進(jìn)行結(jié)果解讀 1 Enrich...

1.6 Y大寬 2 27
【ChIP-seq 實(shí)戰(zhàn)】七腮敌、可視化（IGV部分）
這里是佳奧阱当！獲得了peaks之后我們導(dǎo)入IGV檢查。 1 deeptools初探 bamCoverage的基本用法得到的bw文件就可以送去I...

0.2 佳奧 0 4