在《WGBS 全基因組甲基化測序》)講解了 WGBS 測序原理，簡而言之是 BS 處理將未甲基化 C 轉化為 U(T) 而甲基化的 C 不變狰闪，從...
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Bismark 進行 WGBS 比對 -
WGBS 全基因組甲基化測序DNA甲基化是DNA被添加甲基()修飾影響基因功能或者表達。最常見的甲基化是胞嘧啶產生5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine, 5-m...
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甲基化測序 （WGBS/RRBS/TBS）的去重（de-duplication）問題
關于測序數(shù)據(jù)去重問題網上有很多大神的分析膨处，我就不濫竽充數(shù)了，我挑取了幾篇比較好的文章: 第二代測序原理的詳細解析砂竖！高通量測序之duplicate...
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DNA甲基化測序數(shù)據(jù)處理（二）：差異分析前言 銜接上一篇數(shù)據(jù)比對后的結果真椿，使用R包DSS進行處理。 Input文件準備 我們先來復習一下上一節(jié)課得到的數(shù)據(jù)結果：*.bismark.co...
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DNA甲基化測序數(shù)據(jù)處理（一）：數(shù)據(jù)比對前言 因為組里面出了一批甲基化測序數(shù)據(jù)晦溪，使用的技術為BS-seq瀑粥，處理的時候順帶記錄了學習過程，演示使用數(shù)據(jù)為官方提供的example.fast...
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