轉(zhuǎn)錄組 - 專題

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轉(zhuǎn)錄組

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RNA-seq轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析丨一套完整的案例流程
今天分享的學(xué)習(xí)筆記是一套轉(zhuǎn)錄組分析簡單流程味榛，適用于初學(xué)者入門閱讀沟绪，從原始測(cè)序數(shù)據(jù)開始身坐，經(jīng)過質(zhì)控、序列比對(duì)棕硫、定量表達(dá)、差異表達(dá)、功能富集等一系列分...

2.2 生信分析筆記 2 61
數(shù)據(jù)分析工具推薦 | bulkAnalyseR：用于分析和共享批量多組學(xué)數(shù)據(jù)的交互式工具包
批量測(cè)序?qū)嶒?yàn)（單組學(xué)和多組學(xué)）對(duì)于探索廣泛的生物學(xué)問題至關(guān)重要祠斧。為了促進(jìn)交互式、探索性任務(wù)以及共享易于訪問的信息拱礁，《Briefings in B...

2.6 尐尐呅 0 14

RNA-seq 詳細(xì)教程：分析準(zhǔn)備（3）
學(xué)習(xí)目標(biāo) 了解 RNA-seq 和差異表達(dá)基因的分析流程了解如何設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn) 了解如何使用 R 語言進(jìn)行數(shù)據(jù)分析 1. 簡介在過去的十年中琢锋，RN...

0.1 數(shù)據(jù)科學(xué)工廠 0 4
RNA-seq 詳細(xì)教程：count 數(shù)據(jù)探索（4）
學(xué)習(xí)目標(biāo) 了解 RNA-seq count 數(shù)據(jù)的特征比較 count 數(shù)據(jù)的不同數(shù)學(xué)模型確定最適合 RNA-seq count 數(shù)據(jù)的模型...

0.7 數(shù)據(jù)科學(xué)工廠 0 7
RNA-seq的counts值辕漂，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的異同
RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的異同現(xiàn)在常用的基因定量方法包括：RPM, RPKM, FPKM, ...

1.6 天涯清水 0 19
外泌體多組學(xué)10-尿液細(xì)胞外囊泡miRNA有效數(shù)據(jù)
文章目的：前列腺癌細(xì)胞可以釋放細(xì)胞外囊泡到胞外環(huán)境中并且可以在尿液中被檢測(cè)到吴超，文章對(duì)9個(gè)前列腺癌病人與4個(gè)正常男性的尿液細(xì)胞外囊泡miRNA表達(dá)...

0.1 信你個(gè)鬼 0 1
差異基因通路富集分析的統(tǒng)計(jì)學(xué)假設(shè)和關(guān)于p值的理解
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄譜可以根據(jù)基因表達(dá)水平進(jìn)行差異分析钉嘹，通過差異分析，我們可以知道不同分群之間是否存在差異鲸阻，以及存在顯著表達(dá)量差異的基因集(DEG,在單細(xì)...

0.6 Norahd 0 2

WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因原創(chuàng) 生信技能樹我在生信技能樹多次寫教程分享WGCNA的實(shí)戰(zhàn)細(xì)節(jié)跋涣，見：一文看懂WGCNA...

1.9 天涯清水 0 22
RNA-seq名詞解釋（4）
(五)比對(duì)相關(guān) blast：Basic Local Alignment Search Tool，一種序列比對(duì)的工具鸟悴。 mapping：reads...

1.0 花生學(xué)生信 0 12
RNA-seq名詞解釋（8）
（十）陈辱、分析流程及軟件列表有參轉(zhuǎn)錄組：針對(duì)有參考基因組序列的物種進(jìn)行 mRNA 的分析。無參轉(zhuǎn)錄組：針對(duì)尚無參考基因組序列發(fā)布的物種進(jìn)行 m...

0.9 花生學(xué)生信 0 13