1 原理 詳細(xì)信息參見2013年的QTL-seq 文獻(xiàn)，這里只做簡單介紹。 1.1 群體構(gòu)建 QTL-seq 將 BSA（bulked-segr...

許多重要的農(nóng)藝性狀為數(shù)量性狀叫榕，由多個基因位點(diǎn)控制晃危。利用傳統(tǒng)的分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行基因定位浮声，常常需要花費(fèi)較長的時間和大量的人力物力礁叔。2012年日本巖手...

劉小澤寫于18.7.18表型與基因型相關(guān)聯(lián)（基因定位）是遺傳學(xué)上的重要問題。 什么是重測序Resequencing泼菌？ 我們使用的基因組是怎么來的...

BSA（Bulked Segregant Analysis）恳邀，集群分離分析或分離群體分組分析法。兩個特點(diǎn)：1. 混池2. 性狀分離所以灶轰，BSA可...

QTLseqr是一個用于BSA-seq的R包谣沸，它能夠讀取GATK輸出結(jié)果進(jìn)行過濾，最終使用SNP-index和G 統(tǒng)計值的方法進(jìn)行定位笋颤。我們這次...

BSA雖然不是我最早接觸的高通量數(shù)據(jù)分析項目（最早的是RNA-seq）乳附，但是卻是我最早獨(dú)立開展的數(shù)據(jù)分析項目， 我曾經(jīng)專門寫過一篇文章介紹如何使...

接著上一篇留下的問題伴澄，如何按照以1M為窗口赋除，每次移動10Kb計算均值。我們以KY131是"0/0", 而 "DN422" 是 "1/1"的位點(diǎn)...

下游分析 下游分析可能是比較成熟化的流程分析非凌，對服務(wù)器的要求比較高一些举农，下游分析則是對背景知識要求高一些，例如VCF的格式敞嗡，遺傳學(xué)的三大定律等颁糟。...