Seqkit是一款專門處理fsata/q序列文件的軟件梧奢，由go語言編寫，功能比較完善矩距，軟件使用也很穩(wěn)定。 優(yōu)點1.能夠非常全面的處理fasta/...

NCBI中會將測序等數(shù)據(jù)壓縮成sra格式。本文介紹如何批量下載sra文件及轉(zhuǎn)化為Fastq格式。 下載SRA文件sratoolkit 從NCBI...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)一（軟件安裝） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)二（數(shù)據(jù)下載） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)三（數(shù)據(jù)質(zhì)控） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)五（...

全基因組重測序是對已知基因組序列的物種進(jìn)行不同個體的基因組測序困肩，并在此基礎(chǔ)上對個體或群體進(jìn)行差異性分析。所以首先我們需要某個物種的全基因組序列和...

最近一周開始學(xué)習(xí)ATAC數(shù)據(jù)分析脆侮，目前只是嘗試了簡單分析锌畸，新手小白，如果有小失誤歡迎留言~ 1.準(zhǔn)備環(huán)境 創(chuàng)建conda環(huán)境（如果已有成熟環(huán)境不...

群體進(jìn)化-gwas分析 群體進(jìn)化基礎(chǔ)分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)靖避，即主成分分...

自己在研究生的第一個項目就是處理重測序數(shù)據(jù)幻捏，在做的過程中參考了很多資料盆犁，現(xiàn)在把整個重測序的上游分析流程分享給大家，一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)已經(jīng)幫大家踩過坑了...

劉小澤寫于18.7.18表型與基因型相關(guān)聯(lián)（基因定位）是遺傳學(xué)上的重要問題篡九。 什么是重測序Resequencing谐岁？ 我們使用的基因組是怎么來的...

劉小澤寫于2020.2.8大概回顧一下基礎(chǔ)知識 一：ORF與CDS ORF：open reading frame（開放閱讀框） 它是理論上的蛋白...