這篇文章在2020年7月上傳到了bioRxiv（Inference and analysis of cell-cell communicatio...

在可見(jiàn)的將來(lái)，還會(huì)有大量的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析初學(xué)者咨堤。我們帶著自己已有的知識(shí)背景加入到單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析大軍中來(lái)蜒滩，在我們第一次決定要做單細(xì)胞相關(guān)的工作時(shí)，...

整合受刺激與對(duì)照PBMC數(shù)據(jù)集巡语，以了解細(xì)胞類型特異性反應(yīng) 教程背景 本教程介紹了康等人在2017年提出的兩組pbmc。本實(shí)驗(yàn)將PBMCs分為受刺...

隨著單細(xì)胞數(shù)據(jù)的爆發(fā)時(shí)增加，傳統(tǒng)的科研人員如何方便的探索單細(xì)胞數(shù)據(jù)妖谴，成了急需解決的問(wèn)題窿锉，數(shù)據(jù)解讀才是未來(lái)單細(xì)胞方向的關(guān)鍵，對(duì)于工具的開(kāi)發(fā)是當(dāng)前必...

scRNA基礎(chǔ)分析-1:安裝包膝舅、導(dǎo)入數(shù)據(jù)嗡载、過(guò)濾質(zhì)控 - 簡(jiǎn)書 scRNA基礎(chǔ)分析-2：降維與聚類 - 簡(jiǎn)書 scRNA基礎(chǔ)分析-3：鑒定細(xì)胞...

作者：堯小飛審稿：童蒙編輯：angelica 引言 隨著單細(xì)胞數(shù)據(jù)的增多，單細(xì)胞亞群的鑒定越來(lái)越成為一個(gè)單細(xì)胞分析的一個(gè)關(guān)鍵的仍稀、限制性的過(guò)程洼滚。今...

Seurat官網(wǎng)上詳細(xì)的指導(dǎo)完全可以滿足Seurat包初級(jí)使用。不過(guò)該網(wǎng)站是英文的技潘，為了方便大家迅速上手遥巴，我來(lái)走一遍標(biāo)準(zhǔn)流程。我用的是Windo...

10X Adult Mouse Brain 在本示例中享幽，我們將分析來(lái)自10X genomics平臺(tái)測(cè)序產(chǎn)生的5000個(gè)成年小鼠大腦細(xì)胞的數(shù)據(jù)集铲掐。...

2020/5/26 今天介紹的文獻(xiàn)是美國(guó)哈佛大學(xué)和麻省理工學(xué)院的學(xué)者于2019年7月在Cell上發(fā)表的，名為Intra- and Inter-c...

這個(gè)專題叫Schedule for Single-cell RNA-seq workshop值桩，那就把這個(gè)專題叫做【scRW】吧 第二課 Intr...