最近打算開始寫一個多組學(包括宏基因組/16S/轉(zhuǎn)錄組/蛋白組/代謝組)關聯(lián)分析的R包,避免重復造輪子持寄,在開始之前隨便在網(wǎng)上調(diào)研了下目前已有的R...
![240](https://upload.jianshu.io/collections/images/2007625/crop1683401034112.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
最近打算開始寫一個多組學(包括宏基因組/16S/轉(zhuǎn)錄組/蛋白組/代謝組)關聯(lián)分析的R包,避免重復造輪子持寄,在開始之前隨便在網(wǎng)上調(diào)研了下目前已有的R...
如題 自由發(fā)揮自由擴散
對于基因芯片Array測序數(shù)據(jù)掂碱,基因是與探針(probe)存在對應關系,而不同平臺(platform)的探針與基因?qū)P系都是不同的社牲。因此在挖掘...
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前面測試過monocle2/3熔掺,但是在畫圖的時候置逻,尤其是用默認軟件畫圖的時候總是覺得不夠好看备绽。比如下面這個paper中的數(shù)據(jù)(https://p...
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2018年6月Nature Methods上發(fā)表了一篇關于機器學習分析特定基因集內(nèi)部關系工具的文章忿等,簡單來說就是贸街,通常我們做了差異基因分析得到一...
一逸尖、為什么需要用 Lasso + Cox 生存分析模式 一般我們在篩選影響患者預后的變量時娇跟,通常先進行單因素Cox分析篩選出關聯(lián)的變量太颤,然后構(gòu)建...
在進行一些數(shù)據(jù)分析是經(jīng)常會需要將一個數(shù)據(jù)對象轉(zhuǎn)化為矩陣,以及稀疏矩陣(sparse matrix)和稠密矩陣之間的互化栋齿。 問題&報錯 在R環(huán)境中...