最近有小伙伴問道一個(gè)問題换途,如何在一個(gè)單細(xì)胞UMAP/TSNE圖上展示多個(gè)marker基因的表達(dá)困乒,乍一看挺簡單的踏兜,后來也是思考了一些時(shí)間斜友,慢慢解決...

最近有小伙伴問道一個(gè)問題换途,如何在一個(gè)單細(xì)胞UMAP/TSNE圖上展示多個(gè)marker基因的表達(dá)困乒,乍一看挺簡單的踏兜,后來也是思考了一些時(shí)間斜友,慢慢解決...
更多精彩請(qǐng)至《KS科研分享與服務(wù)公眾號(hào)》除了之前說過的三種常見單細(xì)胞基因可視化方法外炸裆,還有一種最常用的就是直接在UMAP或者TSNE降維圖上顯示...
跟著 Cell 學(xué)作圖 | 5.UMAP降維分析 “實(shí)踐是檢驗(yàn)真理的唯一標(biāo)準(zhǔn)∠势粒”“復(fù)現(xiàn)是學(xué)習(xí)R語言的最好辦法烹看。” DOI: 10.1016/j....
在自然群體(區(qū)別于強(qiáng)人工選擇)中洛史,如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關(guān)聯(lián)性惯殊,隨著環(huán)境變量的改變而變化,則這些環(huán)境變量往往...
一也殖、安裝 1土思、conda install -c conda-forge umap-learn 2、進(jìn)入R:devtools::install_g...
今天學(xué)習(xí)繪制下面這個(gè)paper里面的一個(gè)圖。 從圖中己儒,可以看出崎岂,圖片分成2個(gè)部分,左邊是進(jìn)化樹闪湾,右邊是類似氣泡圖冲甘。 下面我們用一組簡單的文件進(jìn)行...
|本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”公眾號(hào)途样,https://mp.weixin.qq.com/s/04FA3O4QVwg9CNtHBWbUYw[https...
本文包括內(nèi)容: 1. 基因長度定義 非冗余外顯子(EXON)長度之和;挑選基因的最長轉(zhuǎn)錄本 ;選取多個(gè)轉(zhuǎn)錄本長度的平均值;非冗余 CDS 長度之...
論文 The evidence remains clear: SARS-CoV-2 emerged via the wildlife trade...
3010份亞洲稻群體重測序項(xiàng)目是由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所牽頭江醇,聯(lián)合國際水稻研究所、華大基因等16家單位共同完成娘纷。該研究對(duì)來自89個(gè)國家的3...