最近在做一個分析的時候夷野，需要使用到python案站，而我的單細胞數(shù)據(jù)是seurat對象惑惶，所以需要轉(zhuǎn)化一下太援，變成h5ad。關(guān)于seurat轉(zhuǎn)h5ad的...

先來個簡單的，之前有小伙伴咨詢一篇Cell文章中的餅圖，展示的是celltype比例汁讼，其實之前我們寫過很多展示細胞比例的圖，這里復(fù)現(xiàn)這個3D版的...

看到了一篇Nature的UMAP圖，展示的是單細胞嘿架，但是特點是標記了celltype的同時指示了marker基因瓶珊。顯然這個處理很有特色，我們可以...

和之前雙細胞去除一樣耸彪，伞芹，單細胞轉(zhuǎn)錄組分析去除環(huán)境污染RNA也是一個可選的內(nèi)容。為什么會出現(xiàn)這么一個問題呢搜囱，還是受限于目前的單細胞技術(shù)而已丑瞧。通俗的...

起因是有小伙伴咨詢，做柱狀圖的時候蜀肘，怎么添加趨勢線，其實很簡單稽屏，添加一個線性擬合圖層即可扮宠。剛好最近看到這種圖，在做分組表達量箱線圖或者小提琴圖的...

好看的圖千千萬狐榔，我就中意這一款坛增。關(guān)于作圖的注釋，有很多種方法薄腻，有段時間收捣，我很中意線條式的注釋。一般情況庵楷，用AI直接畫挺方便罢艾，但是還是想使用代碼進...

近期在看文獻找圖的時候，看到一篇文章尽纽，一個詞走進我的眼簾咐蚯，Ingenuity Pathway Analysis（IPA），很熟悉弄贿，又很陌生春锋。熟悉...

之前微信群里小伙伴求助了一張圖，是一篇NC中關(guān)于cellchat結(jié)果的展示圖差凹。特點是它的弦圖不像一般圖一樣只展示互作數(shù)目期奔，而是展示細胞受配體。原...

接粉絲”舉報“危尿，對于一篇Science文章中的圖表感興趣呐萌，在復(fù)現(xiàn)的過程中，我發(fā)現(xiàn)另外一張讓人感覺還可以的圖形脚线，是關(guān)于富集結(jié)果的展示搁胆。富集分析真的...