這篇文章很長,超過1萬字,是本系列中最重要的一篇,因為我并非只是在簡單地告訴大家?guī)讞l硬邦邦的操作命令霉囚。對于新手而言不建議碎片時間閱讀窒悔,對于有一定...
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在WGS數(shù)據(jù)的分析過程中俯渤,我們會接觸到許多生物信息學/基因組學領(lǐng)域所特有的數(shù)據(jù)文件和它們特殊的格式馍忽,在這一節(jié)中將要介紹的FASTA和FASTQ便...
前言 基因測序已是時下熱門,目前除了華大基因之外妨猩,其他分布于全中國的大型測序平臺(HiSeq X 10)還有約10個潜叛,每個每年大概能完成1.8萬...
更新日期:2018/3/13 這里匯總一些生信分析和數(shù)據(jù)可視化相關(guān)的推文或筆記,為知筆記里存的東西太雜太亂壶硅,花了一天的時間初步整理了下威兜。點擊跳轉(zhuǎn)...
最近讀到一篇博文,介紹了學習 RNAseq 數(shù)據(jù)分析非常推薦的兩篇綜述和七個在線教程并發(fā)表了相關(guān)評論庐椒。本文將進行簡要整理并對相關(guān)評論內(nèi)容進行大致...
00 寫在前面 測序后公司交付數(shù)據(jù)時椒舵,一般會提供質(zhì)控后的clean data和后續(xù)的基礎(chǔ)分析結(jié)果。因為可能需要自己來進行數(shù)據(jù)的預處理约谈,記得一定要...
前言:觀看B站孟浩巍的系列視頻2017-08-04-高通量測序技術(shù)交流錄像笔宿,內(nèi)容頗多,直接記錄筆記代碼棱诱,沒有經(jīng)過本地運行泼橘,僅作記錄,他日再做梳理...
前言 在前面的一系列WGS文章中迈勋,我講述了很多基因數(shù)據(jù)分析的來龍去脈炬灭,雖然許多同學覺得很有幫助,但是卻缺了一個重要的環(huán)節(jié)——沒有提供實際可用的數(shù)...
這是我根據(jù)之前的WGS系列和GATK4實踐文章進行重新梳理之后確定下來的分析流程靡菇,這是一個WGS的最佳實踐重归,它基于GATK4和我的實際經(jīng)驗米愿,稍作...
先丟鏈接http://bioinformatics.sdstate.edu/idep/ 能做什么?可視化見過最全的的在線RNA-seq分析鼻吮,把這...