背景許多短讀reads組裝的基因組被發(fā)現(xiàn)是不完整的并且包含錯誤。脊椎動物基因組計劃一直在生產新的參考基因組組裝,重點是盡可能完整和無錯誤,這需要...
背景許多短讀reads組裝的基因組被發(fā)現(xiàn)是不完整的并且包含錯誤。脊椎動物基因組計劃一直在生產新的參考基因組組裝,重點是盡可能完整和無錯誤,這需要...
寫在前面 當我們關注某個基因時,在計劃對其開始基因功能研究之前乔宿,往往需要先做「基因家族分析」,原因有幾: 通過演化樹分會初步判斷基因可能功能; ...
2023年3月10日桥狡,來自波多黎各大學Van Belleghem等多團隊合作在國際頂級期刊《Science》上在線發(fā)表了題為“High leve...
基于組裝好的基因組,例如某一個基因在該基因組中無注釋皱卓,需檢查是否為注釋錯誤裹芝,還是該基因本身缺失。 軟件:genblastg和genewise g...
Dr. Qi Sun是康奈爾大學高級研究員和生物信息學中心主任娜汁,長期以來從事生物信息學工作嫂易,在大數(shù)據(jù)的管理與分析上,特別是Genotype-By...
0_1 前言 有時間再詳細寫introduction掐禁。先把我分析數(shù)據(jù)的流程記錄下來怜械,后續(xù)持續(xù)更新。 0_2 用到的軟件或腳本 測序數(shù)據(jù)質控:fa...
0.僅作個人筆記使用意思就是只考慮我能不能看懂具體每個參數(shù)的含義參照官方文檔, 這里全部用默認參數(shù)https://wgdi.readthedoc...
https://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/ChromoSSE] 1.輸入文...
GFAP注釋 go和kegg注釋結果 實測比eggnogmaper的結果更全一點
寫在前面 Emmm傅事,基因組組裝質量的評估標準有很多缕允,伴隨著測序技術的飛速發(fā)展,尤其是 pacbio hifi 和 nanopore蹭越,現(xiàn)在越來越多...