發(fā)簡信
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2023-07-11 crossMap不同版本基因組位點(diǎn)坐標(biāo)轉(zhuǎn)換
CrossMap[https://crossmap.sourceforge.net/#installation] installation do...
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2023-06-14 perl中模式匹配后使用pos()返回匹配位置的問題
總結(jié)：如果使用全局修飾符/g，那么下次匹配會從上次匹配的中止位置開始；而不是從0開始侥袜；所以在做if篩選條件【if(base2=~/TACG/ )...
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2023-06-09 scRNA-seq分析個人分析記錄貼
前言 scRNA-seq越來越成為一種常規(guī)測序內(nèi)容锌蓄，最近正好分析一些scRNA-seq的數(shù)據(jù)璧亚，把分析過程記錄下來楔绞，便于后續(xù)再次使用慎菲。對于走過的坑...
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2023-05-31 windows下Docker的安裝
下載DockerDownload Docker Desktop | Docker[https://www.docker.com/products...
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2022-11-14 bigwig文件轉(zhuǎn)換為bed文件在數(shù)據(jù)分析的時候經(jīng)常碰到各種文件格式的相互轉(zhuǎn)換框喳，UCSC[http://genome.ucsc.edu/util.html]提供了一些工具课幕。去A...
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2022-10-10 samtools分析測序基因組的depth和coverage
對基因組測序完成后厦坛，我們經(jīng)常需要統(tǒng)計測序深度（depth）和對基因組的覆蓋率（coverage） 這兩個概念有時候不太好區(qū)分，有時coverag...
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2021-10-26 RNA-seq分析個人記錄帖
a.整體流程及相關(guān)軟件 數(shù)據(jù)資源下載乍惊，參考基因組及參考注釋組 數(shù)據(jù)質(zhì)控及相關(guān)軟件fastp (代替fastqc粪般，multiqc， trimmom...
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2021-08-23 ChIP-seq數(shù)據(jù)分析流程（從頭到尾）
傳送門[http://www.reibang.com/p/96688fecd864]
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2021-08-09 MAnorm差異分析-一款尋找兩個ChIP-Seq樣本之間差異peak的軟件
3.2 第二種方式MAnorm差異分析-一款尋找兩個ChIP-Seq樣本之間差異peak的軟件 軟件網(wǎng)址：https://manorm.read...