前言 WGDI軟件對(duì)于比較基因組分析非常實(shí)用席吴，能夠分析全基因組復(fù)制事件涎跨，識(shí)別同源區(qū)塊，畫(huà)共線性點(diǎn)陣圖回溺，求ka、ks值等，小編接下來(lái)先帶你安裝該軟...
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WGDI軟件（一）：安裝與配置
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WGDI | 比較基因組分析神器累贤，要啥有啥！寫(xiě)在前面 Emmm少漆，前面推送了幾期好基友-比較基因組小王子的 WGDI 軟件使用和比較基因組圖表解讀臼膏。后臺(tái)常常受到消息，大體意思“快更新示损！”渗磅。原...
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用以判斷選擇壓力的Ka/Ks的計(jì)算前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)、遺傳、基因組進(jìn)化等的文獻(xiàn)始鱼，其中有個(gè)很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值仔掸，（Ka/Ks）。發(fā)現(xiàn)在國(guó)內(nèi)的資料...
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組學(xué)工具合集
組學(xué)工具合集 整理了一些目前知道的與組學(xué)相關(guān)的工具医清，可能不全面起暮，歡迎補(bǔ)充 基因組學(xué) 一代組裝 Celera Assembler: 最具代表性的工...
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全基因組復(fù)制 WGD |（二）Ka/Ks及4Dtv值計(jì)算轉(zhuǎn)自：http://www.reibang.com/p/9d28de3d18e6[http://www.reibang.com/p/9d28...
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如何用WGDI進(jìn)行共線性分析(下)
在上一篇教程的最后，我寫(xiě)道「我們能夠更加直觀的觀察到2個(gè)peak会烙，基本確定2個(gè)多倍化事件」鞋怀。這里就引出了一個(gè)問(wèn)題，為什么我們可以根據(jù)peak來(lái)推...
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如何用WGDI進(jìn)行共線性分析(中)
Ks可視化 我們?cè)谏弦黄绾斡肳GDI進(jìn)行共線性分析(一)[http://xuzhougeng.top/archives/comparative...
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如何用WGDI進(jìn)行共線性分析(上)多倍化以及后續(xù)的基因丟失和二倍化現(xiàn)象存在于大部分的物種中, 是物種進(jìn)化的重要?jiǎng)恿Τ炙选Ｈ绻粋€(gè)物種在演化過(guò)程中發(fā)生過(guò)多倍化密似，那么在基因組上就會(huì)存在一...
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WGD（全基因組復(fù)制）分析——Ka/Ks及4Dtv值計(jì)算一、4Dtv（四倍簡(jiǎn)并位點(diǎn)顛換率）的定義 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative)...
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【豆科基因組】綠豆Mungbean, Vigna radiata基因組2014NC來(lái)源 Kang, Y., Kim, S., Kim, M. et al. Genome sequence of mungbean and ins...
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