說在前面： 早在 2009 年寓辱，韓斌團(tuán)隊(duì)（第一作者是黃學(xué)輝）就在 Genome Res 上發(fā)了一篇文章 High-throughput geno...

寫在前面 快一年了奶稠，寫了重測序三兄弟插件因妙，幾乎所有用戶都可以用 TBtools 輕松完成 BSAseq 數(shù)據(jù)分析钠导。當(dāng)然种柑，我自己基本也沒怎么折騰過...

通過前面兩篇文章對MutMap原理和分析流程的介紹，我們對MutMap的分析已經(jīng)有了比較深入的了解定欧，是時(shí)候來點(diǎn)兒數(shù)據(jù)實(shí)戰(zhàn)一下了渔呵！ MutMap的...

文末可下載示例數(shù)據(jù)和代碼。 前幾天砍鸠，老師讓我畫一個(gè)這樣的圖扩氢。 粗略一看，似乎沒有什么特別困難的地方爷辱，好像之前也看到過類似的圖录豺，但是看到老師發(fā)來的...

binmapr是我折騰的一個(gè)R包，它能夠?qū)GS測序得到SNP數(shù)據(jù)基于binmap進(jìn)行糾錯(cuò)饭弓，用于更好的遺傳定位双饥。 在閱讀本文之前，請先花點(diǎn)時(shí)間看...

QTLseqr是一個(gè)用于BSA-seq的R包弟断，它能夠讀取GATK輸出結(jié)果進(jìn)行過濾咏花，最終使用SNP-index和G 統(tǒng)計(jì)值的方法進(jìn)行定位。我們這次...

許多重要的農(nóng)藝性狀為數(shù)量性狀阀趴，由多個(gè)基因位點(diǎn)控制昏翰。利用傳統(tǒng)的分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行基因定位，常常需要花費(fèi)較長的時(shí)間和大量的人力物力刘急。2012年日本巖手...

BSA雖然不是我最早接觸的高通量數(shù)據(jù)分析項(xiàng)目（最早的是RNA-seq）棚菊，但是卻是我最早獨(dú)立開展的數(shù)據(jù)分析項(xiàng)目， 我曾經(jīng)專門寫過一篇文章介紹如何使...

BSA（Bulked Segregant Analysis）叔汁，集群分離分析或分離群體分組分析法统求。兩個(gè)特點(diǎn)：1. 混池2. 性狀分離所以，BSA可...