發(fā)簡信
IP屬地：江西
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互幫互助問答帖
雖然沒有幾個關注，但能看到這些筆記的應該都是同志們 有時候朋友的私信我可能看不到屁倔，我也不一定能解決卵凑。 群體遺傳學方面、生信方面貌虾、R語言等等吞加，如果...
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跟 Susan R. McCouch 學習單基因的進化分析基于 Susan R. McCouch 同期的兩篇文獻學習一下單基因的進化分析，一篇是發(fā)表在 PNAS 上關于水稻香味基因 BADH2 的分析尽狠，...
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基于 GetOrganelle 組裝葉綠體基因組
GetOrganelle是一款由中國科學院昆明植物研究所的金建軍和郁文彬兩位老師共同開發(fā)的質體組裝軟件衔憨，主要用于從基因組測序數(shù)據(jù)中組裝完整的細胞...
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samtools 一些使用命令
對 SAM 或 BAM 格式的文件進行快速的統(tǒng)計分析： samtools flagstat xx.bam 示例： 415088184 + 0 i...
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LTR finder 和 LTR_retriever 使用說明
LTRfinder是一個用于識別和分析基因組中長末端重復序列（Long Terminal Repeat, LTR）的工具。LTR是一種在許多真核...
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DFOIL 檢驗
DFOIL 檢驗是一種用于確定基因流方向的統(tǒng)計方法袄膏，它基于五群體系統(tǒng)發(fā)育樹的分析践图。DFOIL檢驗是 ABBA-BABA 檢驗的擴展，它通過考慮更...
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ABBA-BABA 檢驗
ABBA-BABA檢驗是一種用于識別基因流的方法沉馆，它基于四群體模型码党，其中包括兩個與第三個群體（P3）密切相關的群體（P1和P2），以及一個外群（...
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awk 從一串字符中提取特定部分
Parent=Os01t0115700-00 從這個字符中提取 Os01t0115700 echo "Parent=Os01t01...
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基于 RepeatModeler 預測基因組的重復序列重復序列在基因組中廣泛存在斥黑，包括轉座子揖盘、簡單重復序列和低復雜度區(qū)域等。這些重復序列對于基因組結構锌奴、功能和進化具有重要影響兽狭。RepeatModel...