linux作業(yè) - 專題

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linux作業(yè)

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fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí)
這個(gè)是有機(jī)結(jié)合生物信息學(xué)的linux和數(shù)據(jù)格式的練習(xí)題：下載bowtie2軟件后拿到示例數(shù)據(jù)： 1）統(tǒng)計(jì)reads_1.fq 文件中共有多少條序...

2.5 林楓bioinfo 0 4
sam和bam格式文件的shell小練習(xí)
首先使用bowtie2軟件自帶的測(cè)試數(shù)據(jù)生成sam/bam文件歌殃，代碼如下： LINUX練習(xí)題統(tǒng)計(jì)共多少條reads（pair-end read...

1.9 林楓bioinfo 0 7

VCF格式文件的shell小練習(xí)
首先使用bowtie2軟件自帶的測(cè)試數(shù)據(jù)生成sam/bam文件乔妈，還有vcf文件代碼如下： LINUX練習(xí)題把突變記錄的vcf文件區(qū)分成 IND...

0.4 林楓bioinfo 1 5
生信技能樹--Jimmy - Linux 20題
一、在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列氓皱。二路召、在創(chuàng)建好的文件夾下面勃刨，比如我的是 /Users/jim...

Hannahhao 0 1
生信人的linux考試
一、在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列二股淡、在創(chuàng)建好的文件夾下面身隐，比如我的是 /Users/jimm...

1.6 林楓bioinfo 2 6
Linux學(xué)習(xí)總結(jié)
1. 為什么要學(xué)習(xí)使用Linux系統(tǒng)？官方解釋：Linux優(yōu)點(diǎn)：1.批量唯灵；2.高效贾铝；3.多用戶實(shí)際解釋：90%生物信息學(xué)軟件均在Linux上運(yùn)...

貓嘰先森 0 1
生信隨手記2020-03-18：shell腳本展示fastp修剪結(jié)果
從修剪前后的fastq文件中各取100000行，將fastq格式文件每個(gè)序列的4行合并為1行埠帕，分別保存為raw.txt和filter.txt 從...

0.1 貓嘰先森 0 1

生信軟件安裝記錄
bowtie2 bcftools

貓嘰先森 0 0
【生信技能樹】VCF格式文件的shell小練習(xí)
首先友情宣傳生信技能樹全國(guó)巡講:R基礎(chǔ)垢揩，Linux基礎(chǔ)和RNA-seq實(shí)戰(zhàn)演練 : 預(yù)告：12月28-30長(zhǎng)沙站廣州珠江新城GEO數(shù)據(jù)挖掘滾...

0.8 貓嘰先森 0 8
【生信技能樹】fa和fq格式文件的shell小練習(xí)
【生信技能樹】fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí)這個(gè)是有機(jī)結(jié)合生物信息學(xué)的linux和數(shù)據(jù)格式的練習(xí)題：下載bowtie2軟件后拿...

0.1 貓嘰先森 0 3